关于“父子两人分两户申请两处宅基地是否合法”的问题，这确实是一个涉及多方面因素和法律条款的复杂议题。以下是我为您提供的详细分析，希望能帮助您更清晰地理解这一问题。
首先，我们需要明确的是，农村宅基地的分配和使用通常遵循“一户一宅”的原则，这是为了保障农村土地资源的合理利用和公平分配。然而，在特定情况下，父子两人分两户申请两处宅基地也可能是合法的，这主要取决于以下几个关键因素：
分户条件：
- 父子两人如果实际上已经符合分户条件，比如年龄、婚姻状况、独立生活能力等，并且已经按照当地户籍管理制度完成了分户手续，那么他们分别申请宅基地是合法的。
宅基地取得方式：
- 如果两处宅基地都是通过合法途径取得的，比如通过继承、购买（在符合当地政策的前提下）、或者因管理部门衔接问题而合法获得，那么这两处宅基地都是合法的。
- 特别是继承情况，根据我国法律规定，继承人可以继承被继承人的房屋并获得相应宅基地使用权，即使已拥有一处宅基地，这种情况下形成的一户两宅（在分户后）也是合法的。
宅基地面积标准：
- 即使父子两人分两户申请宅基地，也需要确保两处宅基地的总面积未超过当地规定的宅基地面积标准。如果总面积超标，那么超出的部分可能被视为违法占地。
实际使用情况：
- 两处宅基地的使用必须符合相关规定和法律条款，比如一处用于居住，另一处用于农业生产或其他合法用途。如果宅基地被用于非法用途，比如建设违章建筑或进行商业活动，那么这种使用是不合法的。
地方性规定：
- 不同地区可能有具体的宅基地管理规定，这些规定可能因地区而异。因此，在判断父子两人分两户申请两处宅基地是否合法时，还需要查阅并遵守当地的相关法律法规及政策文件。
综合建议：
- 如果您和您的父亲已经符合分户条件，并且打算分别申请宅基地，建议您先了解当地的具体政策和规定，确保您的申请符合所有要求。
- 在申请过程中，务必保持透明和合法，避免采用任何非法手段获取宅基地。
- 如果您对当地政策或法律条款有任何疑问，建议咨询当地相关部门或专业律师以获取更准确的法律意见和指导。
总之，父子两人分两户申请两处宅基地的合法性并非一概而论，而是需要根据具体情况进行综合判断。希望以上分析能对您有所帮助。