公司安全管理制度本身无权直接设定对员工上下班骑电动车不戴头盔的罚款规定，但公司可以依据内部规章制度进行一定的管理措施，具体需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 公司规章制度的合法性基础
   根据《劳动合同法》第四条，用人单位制定规章制度需满足三个条件：内容合法、经民主程序（如职工代表大会讨论）、向劳动者公示。若公司安全管理制度中关于“骑电动车不戴头盔罚款”的规定未经上述程序，或内容违反《道路交通安全法》等法律法规，则该条款可能被认定为无效。

2. 罚款的合法性限制

   • 行政处罚权专属：根据《行政处罚法》，只有行政机关（如交警部门）有权对交通违法行为进行罚款。公司作为民事主体，无权直接对员工实施行政处罚。
     
   • 经济处罚的替代方案：若公司希望强化安全意识，可通过以下合法方式：
     
     • 培训教育：组织交通安全培训，要求员工签署安全承诺书；
       
     • 绩效考核挂钩：将安全行为纳入绩效考核，影响奖金或晋升；
       
     • 内部通报：对违规行为进行内部通报批评（需注意保护员工隐私）。
       

3. 地方性法规的特殊规定
   部分地区（如深圳、杭州）的《企业事业单位内部治安保卫条例》允许企业制定内部安全规定，但罚款仍需符合“不违反法律、法规强制性规定”的前提。若地方性法规明确授权企业可对特定安全违规行为设定内部处罚，且程序合法，则可能部分有效，但此类情况较为罕见。

4. 员工权益保护建议

   • 核查制度程序：要求公司出示规章制度的民主制定程序记录及公示证据；
     
   • 拒绝非法罚款：若公司强行扣款，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；
     
   • 协商解决：建议与公司沟通，提出以培训、警示等替代方式落实安全管理。

总结：公司安全管理制度中直接设定罚款条款存在法律风险，但可通过合法管理措施督促员工遵守交通规则。若您遇到类似情况，可进一步向我提供具体制度内容及实施细节，我将为您分析合规性及应对方案。