关于面包车改装天窗是否合法的问题，这主要涉及到机动车改装的相关法律法规以及道路交通安全的规定。

首先，我们需要明确的是，任何单位或者个人都不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征，这是根据《山东省机动车非法改装治理和噪声污染防治规定》以及其他相关法律法规的明确要求。机动车的结构、构造和特征，包括但不限于车身颜色、发动机、车架、悬挂系统、制动系统以及车窗等，都是车辆登记时的重要信息，也是车辆安全行驶的重要保障。

对于面包车改装天窗这一行为，它直接改变了车辆原有的结构，即车顶部分。这种改变可能会影响到车辆的强度、稳定性以及安全性，甚至可能违反车辆制造和安全标准。因此，从法律和安全的角度来看，面包车改装天窗是不被允许的。

此外，我们还需要注意到，即使改装后的天窗在技术上可能符合某些安全标准，但由于它改变了车辆原有的登记信息，因此仍然可能面临法律上的风险。例如，车辆可能无法通过年检，或者在道路上行驶时被交警部门查处并要求恢复原状，甚至可能面临罚款等处罚。

综上所述，我建议您不要对面包车进行天窗改装。如果您希望改善车内的通风和采光条件，可以考虑使用其他合法且安全的方式，如安装车窗遮阳帘、使用车载空气净化器等。这样既能满足您的需求，又能确保车辆的安全和合法性。