结论：若合同中明确约定了甲方所在地法院为管辖法院，那么乙方通常不能在其他法院（如乙方所在地法院）提起诉讼，但存在特殊情况。

详细分析：

1. 合同约定优先：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。
   • 若合同中明确约定了“甲方所在地法院起诉”，这属于双方对管辖法院的明确约定，且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，因此是有效的。在此情况下，乙方应当遵循合同约定，向甲方所在地法院提起诉讼。

2. 特殊情况下的管辖：

   • 约定无效或不明确：如果合同中的管辖约定因违反法律、行政法规的强制性规定或者存在其他无效情形（如欺诈、胁迫等），或者约定不明确、无法确定具体的管辖法院，那么该约定可能无效。此时，根据《民事诉讼法》的一般规定，被告住所地或者合同履行地法院可能具有管辖权。
   • 专属管辖：对于某些特定类型的案件，如因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院专属管辖。如果合同纠纷涉及不动产，且属于专属管辖的范围，那么即使合同中有其他管辖约定，也可能因违反专属管辖的规定而无效。
   • 协议管辖的例外：虽然双方可以协议选择管辖法院，但如果一方在合同签订后、纠纷发生前，通过欺诈、胁迫等手段使对方在违背真实意思的情况下签订管辖协议，或者双方在纠纷发生后恶意串通，通过签订管辖协议来规避法律、逃避管辖，那么该管辖协议可能被认定为无效。

3. 实际操作建议：

   • 审查合同：乙方在提起诉讼前，应仔细审查合同中的管辖条款，确认其是否有效、明确，并了解甲方所在地的具体信息。
   • 咨询律师：如果乙方对合同中的管辖条款存在疑问，或者认为存在特殊情况可能导致管辖约定无效，建议咨询专业律师，以便更准确地判断管辖法院。
   • 准备证据：无论选择哪个法院提起诉讼，乙方都应准备充分的证据来支持自己的主张，包括合同文本、履行情况、沟通记录等。

后续行动建议：

• 如果乙方认为合同中的管辖约定存在问题，或者存在其他特殊情况，建议及时与甲方沟通协商，尝试通过友好方式解决纠纷。
• 如果协商无果，乙方可以根据实际情况选择向甲方所在地法院提起诉讼，或者根据法律规定和实际情况选择其他有管辖权的法院。在此过程中，务必确保自己的诉讼行为符合法律规定和合同约定。

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