农村信用社逾期一年，协商只还本金加利息而不还罚息，银行不同意，此情况下一般应遵守合同约定，按约定偿还罚息。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 合同约定的法律效力

1. 合同条款的约束力：根据《中华人民共和国合同法》第八条，“依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同”。农村信用社与借款人之间的借款合同，一旦签订，即具有法律约束力，双方都应遵守。
2. 罚息条款的合法性：借款合同中通常会明确罚息的计算方式和标准，这是银行为防范风险、保障资金安全而设定的。罚息条款作为合同的一部分，同样具有法律效力。

二. 协商还款的可行性

1. 协商基础：虽然借款人有权与银行协商还款事宜，但协商的基础是双方都能接受的条件。银行作为金融机构，有其自身的运营成本和风险控制要求，因此不太可能轻易放弃罚息。
2. 银行立场：银行不同意只还本金加利息而不还罚息，很可能是出于对自身利益的考虑。罚息是银行对逾期还款行为的一种惩罚措施，也是其收入来源之一。

三. 法律后果与建议

1. 法律后果：如果借款人坚持只还本金加利息而不还罚息，可能会面临银行提起的诉讼或仲裁，最终导致信用记录受损、资产被查封或拍卖等严重后果。
2. 我的建议：我建议借款人应遵守合同约定，按约定偿还本金、利息及罚息。如果确实存在还款困难，可以与银行进一步协商，寻求延期还款、分期还款等解决方案，但前提是双方都能接受并遵守新的还款协议。

综上所述，农村信用社逾期一年，协商只还本金加利息而不还罚息，银行不同意的情况下，借款人应遵守合同约定，按约定偿还罚息。如有进一步需要，您可以继续咨询我。