商家可通过协商、民事诉讼或申请支付令的方式追回付错款项。具体分析如下：

1. 协商解决
   商家发现付错款项后，应第一时间与顾客取得联系，说明情况并提供付款凭证（如转账记录、付款截图等），要求顾客返还多付的款项。若顾客认可事实并同意返还，双方可协商返还方式（如原路退回、现金返还等）。此方式成本最低、效率最高，建议优先尝试。

2. 民事诉讼
   若协商无果，商家可向法院提起民事诉讼，要求顾客返还不当得利。根据《民法典》第九百八十五条，得利人没有法律根据取得不当利益的，受损失的人可以请求得利人返还取得的利益。商家需准备以下证据：

   • 付款凭证（如转账记录、付款截图等），证明实际付款金额与应付款金额的差额；
     
   • 交易合同、订单记录等，证明双方存在交易关系及应付款金额；
     
   • 沟通记录（如微信、短信等），证明已向顾客主张返还但遭拒。
     若证据充分，法院通常会支持商家的诉求。

3. 申请支付令
   若商家与顾客之间债权债务关系明确（如顾客明确承认多收款项但拒不返还），商家可向法院申请支付令。根据《民事诉讼法》第二百二十一条，债权人请求债务人给付金钱、有价证券，符合条件的，可以向有管辖权的基层人民法院申请支付令。支付令生效后，若顾客在规定期限内未提出异议且不履行返还义务，商家可申请强制执行。此方式程序简便、周期较短，但需满足“债权债务关系明确”的前提条件。

建议：商家在日常经营中应加强财务管理，付款前仔细核对金额，避免类似纠纷。若已发生付错款项的情况，建议优先通过协商解决；协商无果时，及时收集证据并通过法律途径维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。