核心结论：物权抵债后落实部分物权不归抵押人的，需根据具体情形采取不同措施，常见情况及处理方式如下：

1. 若因抵押物被分割或部分灭失导致
   若抵押物因自然原因、第三方侵权或抵押人处分行为（如转让部分抵押物）导致部分灭失或分割，且未征得抵押权人同意，抵押权人可依据《民法典》第390条主张权利：

   • 对剩余抵押物优先受偿：抵押权效力及于剩余部分，抵押权人仍有权就剩余物价值优先受偿。
     
   • 要求抵押人补充担保：若抵押物价值因分割或灭失显著降低，抵押权人可要求抵押人提供与减少价值相当的担保（如补充抵押物、质押或保证）。
     
   • 追究抵押人责任：若抵押人故意处分抵押物导致价值减损，抵押权人可要求抵押人赔偿损失（如要求抵押人以其他财产补偿差额）。

2. 若因抵押权实现方式导致部分物权未归属抵押人
   若抵押物通过拍卖、变卖等方式变现后，部分款项用于清偿债务，剩余部分应返还抵押人；但若抵押物被折价抵债给债权人，且抵押物为不可分割物（如房屋），可能存在以下情形：

   • 共有人协商分割：若抵押物为共有财产（如夫妻共有房屋），抵押人仅对其份额享有权利，剩余部分物权归其他共有人所有，抵押权人仅能就抵押人份额优先受偿。
     
   • 债权人取得完整物权但需补偿：若抵押物整体抵债给债权人，但抵押人仅对部分享有权利（如按份共有），债权人需向其他共有人支付对应份额的补偿款，否则其他共有人可主张物权返还请求权。

3. 若因抵押合同约定或法律限制导致

   • 合同约定优先：若抵押合同明确约定抵押物部分灭失或分割后的处理方式（如“抵押物部分灭失时，抵押权及于剩余部分”），应按约定执行。
     
   • 法律限制情形：若抵押物因公益目的（如学校、医院设施）被征收或征用，抵押权人可就补偿款优先受偿，但剩余物权归国家或集体所有，抵押人无权主张。

行动建议：

• 核查抵押合同：确认合同中是否对部分物权归属有明确约定，如有约定则按约定处理。
  
• 评估抵押物现状：通过现场勘查、产权登记查询等方式，确认抵押物是否被分割、灭失或存在共有情况。
  
• 协商或诉讼解决：与抵押权人、其他共有人协商补偿或分割方案；若协商不成，可向法院提起物权确认之诉或损害赔偿之诉。
  

如有进一步细节（如抵押物类型、抵押合同条款、处分行为是否经同意等），可向我补充说明，以便更精准分析。