结论：关于两人合伙开店欠员工五万工资未给，法人代表被拘留是否会牵连另一人的问题，这取决于另一人是否也涉及拒不支付劳动报酬的违法行为，若另一人同样存在违法行为，则可能面临法律责任；若不存在，则一般不会被拘留。以下从不同角度进行分析：
一、法律责任主体
公司（合伙企业）责任：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位（包括合伙企业）应当按时足额支付劳动者工资。若未支付，则构成违法行为，需承担法律责任。
- 在合伙企业中，所有合伙人均需对企业的债务承担连带责任，这包括欠付的员工工资。
个人责任：
- 作为法人代表，你若直接参与了拒不支付劳动报酬的行为，如故意拖欠、转移财产等，则可能面临行政处罚（如拘留）或刑事责任（如拒不支付劳动报酬罪）。
- 另一合伙人若同样参与了这些违法行为，也将面临相同的法律责任。
二、拘留的适用情形
行政拘留：
- 若因欠付工资问题引发劳动争议，且情节严重（如拖欠数额较大、拖欠时间较长、造成恶劣影响等），劳动行政部门或公安机关可能对直接负责的主管人员和其他直接责任人员采取行政拘留措施。
- 若另一合伙人未直接参与违法行为，则一般不会被行政拘留。
刑事拘留：
- 若欠付工资行为构成拒不支付劳动报酬罪（即以转移财产、逃匿等方法逃避支付劳动者的劳动报酬或者有能力支付而不支付劳动者的劳动报酬，数额较大，经政府有关部门责令支付仍不支付的），则可能面临刑事拘留及后续的刑事审判。
- 刑事拘留及刑事责任需由法院根据具体案情判决，若另一合伙人未参与犯罪行为，则不会被刑事拘留。
三、建议与措施
尽快支付欠付工资：
- 作为合伙企业，应尽快筹集资金支付欠付的员工工资，以避免法律责任的进一步升级。
与员工协商：
- 若确实存在资金困难，可与员工协商分期支付或达成其他和解协议，以减轻法律责任。
咨询专业律师：
- 鉴于法律问题的复杂性，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。我是丁艾东律师，专注于公司事务等领域，若你有相关法律问题，可以直接向我咨询。
配合调查：
- 若已面临劳动行政部门或公安机关的调查，应积极配合并提供相关证据材料，以证明自己的清白或减轻法律责任。