针对您提出的“非法运输5万以下香烟怎么处理”的问题，以下是我根据相关法律法规为您提供的详细解答：
一、行政处罚措施
在非法运输香烟且价值未超过5万元的情况下，您可能会面临以下行政处罚：
罚款：烟草专卖行政主管部门会根据违法情节，对您处以违法运输的烟草专卖品价值20%至50%的罚款。这一处罚措施旨在通过经济手段遏制违法行为。
没收违法所得：如果您因非法运输香烟而获得了经济利益，烟草专卖行政主管部门有权没收这部分违法所得，以剥夺您的非法收益。
收购烟草专卖品：作为替代性处罚，烟草专卖行政主管部门可能会按照查获地省级烟草专卖行政主管部门出具的上年度烟叶平均收购价格的70%收购您违法运输的烟叶，以及按照市场批发价格的70%收购您违法运输的除烟叶外的其他烟草专卖品。
二、特殊情形下的处理
情节轻微：如果您违法运输的香烟价值未超过5万元，且您主动配合调查、认错态度良好，烟草专卖行政主管部门可能会根据具体情况从轻、减轻处罚，如降低罚款金额等。
情节严重：尽管运输香烟的价值未超过5万元，但如果您存在多次违法、抗拒检查或其他严重情节（如非法运输走私香烟、利用伪装或特种车辆逃避检查等），处罚将更加严厉。这可能包括更高的罚款、没收违法运输的香烟以及可能的刑事责任追究。
超限量邮寄或异地携带：如果您是通过邮寄或异地携带的方式运输香烟，且数量超过了国务院有关部门规定的限量（个人在境内携带烟草制品的限量为国产烟10条、进口烟5条），您也将依法受到处罚，可能面临没收或罚款等。
三、刑事责任提示
虽然运输香烟的价值未超过5万元，但如果您的行为存在其他严重情节（如多次非法经营、造成恶劣影响等），可能触犯非法经营罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，非法经营罪情节严重的可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
四、建议与总结
为了避免不必要的法律后果，我建议您严格遵守烟草专卖法律法规，不参与非法运输香烟的活动。如果您需要运输香烟，请确保获得合法的烟草专卖品准运证，并按照规定的数量和路线进行运输。
总之，非法运输5万以下香烟的处理方式主要依据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例的相关规定，可能涉及罚款、没收违法所得、收购烟草专卖品等行政处罚措施，以及可能的刑事责任追究。希望我的解答能够对您有所帮助。