合同中约定去公司所在地起诉，通常是合法的，但需满足一定条件。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、协议管辖的合法性
根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条：“合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。”因此，合同双方在合同中约定去公司所在地（即被告住所地）起诉，是符合法律规定的，这种约定属于协议管辖的一种。
二、协议管辖的有效性条件
书面形式：协议管辖必须采用书面形式，口头约定无效。这意味着合同中的管辖条款应当明确、具体，并作为合同的一部分被双方签署确认。
与争议有实际联系：选择的管辖法院必须与争议有实际联系，如被告住所地、合同履行地等。公司所在地作为被告住所地，通常与争议有实际联系，因此符合这一条件。
不违反级别管辖和专属管辖：协议管辖不得违反法律对级别管辖和专属管辖的规定。例如，对于某些特定类型的案件，法律可能规定了特定的管辖法院，此时双方不能通过协议改变管辖。
三、可能存在的例外情况
格式条款问题：如果合同中的管辖条款是格式条款，且提供格式条款的一方未采取合理方式提示对方注意，或者对方有合理理由认为该条款不公平、不合理，那么该条款可能被认定为无效。但这种情况较为少见，且需要具体证据支持。
欺诈、胁迫等情形：如果合同中的管辖条款是在欺诈、胁迫等情形下订立的，那么该条款也可能被认定为无效。但同样，这需要具体证据来证明。
四、法律建议
审查合同条款：在签订合同时，务必仔细审查合同中的管辖条款，确保其符合法律规定，并明确、具体地约定了管辖法院。
保留证据：如果合同中的管辖条款存在争议，或者你认为该条款可能无效，那么请务必保留好相关证据，如合同文本、沟通记录等，以便在后续的法律程序中维护自己的权益。
咨询专业律师：如果你对合同中的管辖条款有疑问，或者需要进一步的法律建议，那么请直接向我咨询。作为专业律师，我将根据你的具体情况，为你提供全面、准确的法律意见。