您好，针对您在工厂自离后如何办理离职证明的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，无论您是主动辞职还是自离，根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十条的规定，用人单位在解除或终止劳动合同时，都有义务出具解除或终止劳动合同的证明。这份证明，就是我们通常所说的离职证明。

离职证明是一段劳动关系结束的凭证，它应该包含您的姓名、身份证号码、入职日期、离职日期、所在部门、担任职务等关键信息，并需要加盖公司的公章方可生效。这份证明不仅证明了您与原用人单位已经解除了劳动关系，还证明了您是按照正常手续办理离职的，是自由人，可以申请失业金或应聘新的职位，同时也可以凭此转移您的人事关系、社保、公积金等。

针对您自离的情况，虽然您没有按照正常的辞职流程提前通知公司，但公司仍然有义务为您出具离职证明。如果公司拒绝出具，您可以尝试与公司进行沟通，说明您的需求和法律依据。如果沟通无果，您还可以通过劳动仲裁部门提出申诉，要求公司出具离职证明。

另外，如果您目前急需离职证明以入职新公司，而原公司暂时无法出具，您可以先向新公司解释清楚您的情况，并写一个承诺函，承诺您已经与原公司解除了劳动关系，并将其它能够证明您工作经历的材料及承诺函交给新公司保管。如果新公司接受这样的处置方式，并在您签劳动合同入职后，新公司就不能以您没有上家公司的离职证明而随意开除您。

总的来说，无论您是主动辞职还是自离，都有权利要求原公司出具离职证明。如果遇到公司拒绝出具的情况，您可以通过沟通或法律途径来维护自己的权益。希望我的解答能够对您有所帮助。