若您未按照协议在三个月内还清欠朋友的四万多块钱，且未与朋友达成新的还款协议，朋友选择通过法律途径解决，法院可能会采取以下措施：
立案与审理：
- 朋友作为原告，会向法院提交起诉状及相关证据，如借条、转账记录、还款协议等，以证明您欠款的事实及金额。
- 法院在收到起诉状后，会进行审查，符合立案条件的，会予以立案，并通知您作为被告应诉。
- 随后，法院会安排开庭审理，双方将有机会在法庭上陈述事实、提供证据，并进行辩论。
判决与执行：
- 经过审理，如果法院认定您确实存在欠款行为，且未按照协议还款，法院会作出判决，要求您在一定期限内还清欠款。
- 如果您在判决规定的期限内仍未还款，朋友可以向法院申请强制执行。
- 法院在受理强制执行申请后，会采取一系列执行措施，如查询、冻结、划拨您的银行账户存款，查封、扣押、拍卖您的财产等，以强制您履行还款义务。
信用影响：
- 未能按时还款且经过法律程序后仍未履行还款义务，可能会对您的个人信用产生负面影响。
- 这种信用污点可能会影响您未来的贷款申请、信用卡办理等金融活动，甚至可能影响您的就业和社交。
针对您的情况，我有以下几点建议：
- 尽快与朋友沟通：尝试与朋友协商，看是否可以达成新的还款协议，如延长还款期限、分期还款等。这有助于维护您与朋友之间的关系，并避免法律纠纷。
- 积极应诉：如果朋友已经提起诉讼，您应积极应诉，提供相关证据以证明自己的还款能力或提出合理的还款计划。
- 履行还款义务：无论最终结果如何，您都应尽力履行还款义务。如果确实无法一次性还清，可以与朋友协商分期还款，并尽量按照协商的计划进行还款。
最后，我想强调的是，法律是维护社会公平正义的基石。在面对债务纠纷时，我们应尊重法律、遵守法律，通过合法途径解决纠纷。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。