结论是：老赖还了欠款后，你继续扣留其房产证是违法的。
一、法律角度分析
物权法相关规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》（原《物权法》相关内容已整合其中）的规定，房产证作为物权凭证，其所有权归属于房产的合法所有者。一旦债务得到清偿，债权人即你，便无权继续扣留债务人的房产证。
- 扣留他人房产证可能构成对物权的侵犯，债务人，即老赖，有权要求你返还，并可能通过法律途径追究你的责任。
债权债务关系终结：
- 当老赖还清欠款后，你们之间的债权债务关系即告终结。此时，你继续扣留房产证已无合法依据。
- 若你以任何理由继续扣留，都可能被视为非法占有或侵权行为，需要承担相应的法律责任。
二、实际操作建议
及时返还房产证：
- 在确认老赖已还清欠款后，你应立即将房产证返还给他。这是遵守法律、维护双方权益的基本要求。
- 返还时，建议双方签署一份书面确认文件，以证明欠款已还清且房产证已返还，避免后续纠纷。
保留相关证据：
- 在整个过程中，你应妥善保留与欠款、还款相关的所有证据，如借条、转账记录、还款确认书等。
- 这些证据在后续可能出现的纠纷中将成为关键性的证明材料。
沟通协商：
- 若在返还房产证的过程中遇到任何问题或争议，建议双方首先通过沟通协商解决。
- 沟通时应保持冷静、理性，避免情绪化行为导致矛盾升级。
三、可能面临的法律后果
民事责任：
- 若你继续扣留房产证且拒绝返还，老赖有权向法院提起民事诉讼，要求你返还房产证并赔偿因此造成的损失。
- 法院在审理此类案件时，通常会依据相关法律法规和事实情况作出公正判决。
行政责任或刑事责任（极端情况下）：
- 在极端情况下，若你的扣留行为被认定为非法占有或侵占他人财物，且情节严重，可能面临行政处罚或刑事责任。
- 虽然这种情况较为罕见，但仍需引起你的高度重视和警惕。
因此，我建议你一旦确认老赖已还清欠款，就立即将房产证返还给他，以避免不必要的法律纠纷和风险。若你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。