结论：村里扣着房产证不给的行为一般是不合法的，个人有权要求村里归还房产证，并可以通过沟通协商、向上级政府部门反映、申请房屋确权以及寻求法律途径等多种方式来维护自己的合法权益。

详细分析与操作指南：

1. 沟通协商

   • 与村委会沟通：首先，你可以尝试与村委会进行友好沟通，了解他们扣留房产证的具体原因。可能是存在误解、手续未完善或文件整理等问题。在沟通时，明确表达你要求返还房产证的诉求，并要求村委会说明扣留的依据。如果村委会能够给出合理的解释，并承诺在一定时间内归还房产证，那么问题可能就此解决。
   • 向上级政府部门反映：若与村委会沟通无果，你可以向乡镇政府或街道办事处等上级政府部门反映情况。这些部门有责任对村委会的工作进行指导和监督，会协助调查并协调解决此事。

2. 向相关部门申请调解与确权

   • 申请调解：你可以向乡镇的人民政府或者相关的行政部门提出正式书面报告，详细说明事情经过及诉求，请求他们帮忙调解。调解过程中，相关部门会听取双方的意见，并尝试促成双方达成和解。
   • 申请房屋确权：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产物权需经依法登记才发生效力。因此，你可以向不动产登记机构或其他相关部门申请房屋确权，以确认自己对房屋的合法所有权。一旦确权成功，这将有力支持你要求村委会归还房产证。

3. 法律途径

   • 申请行政复议：如果你认为村委会扣留房产证的行为具有行政属性且侵犯了你的合法权益，你可以在规定时间内向法定的行政复议机关提出行政复议申请。复议机关将对村委会的行为进行审查，并作出相应决定。
   • 提起民事诉讼或仲裁：若上述方法均无法解决问题，你可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，或者直接向当地仲裁机构申请仲裁。在诉讼或仲裁过程中，你需要提供充分证据（如购房合同、产权登记资料、沟通记录等）来支持自己的诉求。法院或仲裁机构会根据双方提供的证据和相关法律规定进行审理，并作出公正裁决。

4. 保留相关证据

   • 在整个处理过程中，你应妥善保管与房产证相关的所有文件、资料以及与各方的沟通记录等。这些证据将在后续的调解、确权、诉讼或仲裁过程中起到关键作用，有助于你证明自己的权益和主张。

可能面临的法律后果：

• 如果村委会扣留房产证的行为被认定为违法，他们可能需要承担相应的法律责任，包括归还房产证、赔偿损失等。
• 如果你通过法律途径维护自己的权益，并最终获得胜诉，法院或仲裁机构会作出公正裁决，要求村委会归还房产证或进行相应赔偿。

建议：

• 在处理此类问题时，保持冷静和理智至关重要。避免与村委会发生不必要的冲突和争执，以免问题进一步恶化。
• 及时咨询专业律师（如我）的意见，以便更好地了解自己的权益和可行的解决方案。律师可以根据你的具体情况提供个性化的法律建议和指导。

在整个过程中，保留好相关证据是至关重要的。通过综合运用多种手段，你有望有效维护自己的房产证权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。