房款和佣金分开收取并不直接构成违法。关键在于这种收取方式是否符合相关法律法规的规定，以及是否存在欺诈、隐瞒等不正当手段。

1. 法律法规角度：

   • 在房地产交易中，房款是购房人支付给卖房人的款项，而佣金通常是中介机构因提供居间服务而收取的费用。两者性质不同，分开收取在法律上并无直接禁止。
   • 但需注意的是，收取佣金的中介机构必须具备相应的资质，且佣金标准应当合理、透明，不得存在价格欺诈等违法行为。

2. 合同约定角度：

   • 房款和佣金的分开收取应当在合同中明确约定，包括佣金的具体金额、支付方式、支付时间等。
   • 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，可能会引发纠纷。因此，建议在签订合同时，务必明确相关条款，以避免后续争议。

3. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，房款和佣金通常是由不同的主体收取的。房款由卖房人收取，而佣金则由中介机构收取。
   • 分开收取有助于清晰明了地记录交易过程中的各项费用，便于双方核对和结算。

综上所述，房款和佣金分开收取并不直接构成违法，但前提是必须符合相关法律法规的规定，且在合同中明确约定。如果在实际操作中遇到任何疑问或纠纷，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。