农村宅基地合作建房租赁协议书的法律效力，需要根据具体情况来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、合作建房合同受法律保护的情形
首先，合作建房合同本身在满足一定条件下是受法律保护的。这些条件包括：
- 行为人具有民事行为能力：合同双方都必须具备相应的民事行为能力，即达到法定年龄且精神状态正常。
- 意思表示真实：合同的签订必须是双方在自愿、平等的基础上达成的，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 合同内容合法合规：不违法违规，不违背公序良俗，且土地获取、规划建设手续必须合法。这意味着合作建房的土地需要是合法出让的，建房也需按规划进行。
- 符合相关规划和用途管制要求：合作建房需符合当地政府的规划和用途管制要求。
二、农村宅基地房屋租赁合同的特殊规定
对于农村宅基地房屋租赁合同，除需满足上述一般合作建房合同的条件外，还需特别注意以下几点：
- 租赁用途：一般情况下，用于居住的租赁合同是有效的，而用于非居住（如商业经营）的则可能无效。这是因为宅基地具有特定的社会保障和福利性质，主要供本集体经济组织成员居住使用。
- 房屋合法性：宅基地房屋必须建造合法，拥有相关的审批手续。如果房屋是违法建筑或存在产权纠纷，租赁合同将无效。
- 集体经济组织成员限制：宅基地的使用权通常仅限于本集体经济组织成员。如果将房屋出租给非本集体经济组织成员，并且改变了宅基地的原有属性和用途，合同可能会被认定无效。但实践中，各地司法实践对此类合同效力认定可能存在差异。
三、可能无效的情况
农村宅基地合作建房租赁合同在以下情况下可能无效：
- 租赁用途违法：如用于违法犯罪活动。
- 未经合法共有人同意：如果房屋存在多个共有人，但出租人未经其他共有人同意擅自出租。
- 违反宅基地使用规定：如将房屋出租给非本集体经济组织成员用于非居住目的。
- 合同形式不符合要求：租赁期限六个月以上的，应当采用书面形式。未采用书面形式或无法确定租赁期限的，可能影响合同的稳定性和有效性。
四、结论与建议
综上所述，农村宅基地合作建房租赁协议书的法律效力需根据具体情况综合判断。在签订合同时，双方应仔细审查合同条款，确保合同的合法性和有效性。特别是要注意租赁用途、房屋合法性以及集体经济组织成员限制等问题。必要时可咨询专业法律人士以避免潜在的法律风险。