针对您提出的“侵占自建房屋怎么处理合法”的问题，以下是我为您提供的详细、清晰的解答：
一、初步应对措施
与侵占者协商：首先，您可以尝试与侵占者进行友好协商，要求其返还房屋并赔偿因侵占造成的损失。这是一种较为温和且成本较低的解决方式，如果双方能够达成协议，将避免后续的法律纠纷。
收集证据：在协商无果或准备采取法律手段之前，务必收集充分的证据来证明您对房屋的所有权以及侵占者的侵占行为。这些证据包括但不限于房屋产权证明、侵占行为的照片或视频记录、相关证人证言等。
二、法律途径
提起民事诉讼：若协商无果，您可以向人民法院提起民事诉讼，要求侵占者返还房屋并赔偿损失。在诉讼过程中，您需要提交起诉状，并附上相关证据材料。法院将依法审理此案，并根据证据情况作出公正判决。
起诉状内容：起诉状中应明确原告（即您）和被告（即侵占者）的基本信息，诉讼请求（如要求对方返还房屋、赔偿损失等），以及事实与理由部分，详细阐述侵占行为的经过和您的合法权益。
证据提交：在诉讼过程中，您需要向法院提交房屋产权证明、侵占行为的证据等，以证明您的主张。
执行判决：如果法院认定侵占事实成立，将判决侵占者返还房屋并可能判令其赔偿损失。若侵占者不主动履行判决，您可以向法院申请强制执行，以确保您的权益得到实现。
三、刑事责任
如果侵占行为情节严重，如造成房屋较大损坏、长期恶意侵占等，可能涉嫌侵占罪。在这种情况下，您可以向法院提起刑事自诉，要求追究侵占者的刑事责任。根据侵占行为的严重程度和造成的后果，侵占者可能面临二年以下有期徒刑、拘役或者罚金等刑罚。
四、注意事项
诉讼时效：请务必注意诉讼时效问题，避免因超过法定时效而丧失维权机会。
法律援助：如果您在维权过程中遇到困难或需要专业帮助，可以寻求法律援助或咨询专业律师。
综上所述，面对侵占自建房屋的情况，您应首先尝试与侵占者协商；协商无果后，通过收集证据、提起民事诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。在整个过程中，请务必保持冷静和理性，遵循法定程序，以确保您的权益得到有效保障。