房屋买卖协议可以向法院提异议，且在一定条件下是有效的。具体分析如下：
一、可提异议的情形及有效性
合同存在可撤销事由：
- 若房屋买卖协议中存在欺诈、胁迫、重大误解等可撤销情形，例如卖方故意隐瞒房屋的重大质量问题，或者利用优势地位或对方缺乏经验，致使合同条款显失公平，那么买方或卖方可以在知道或应当知道撤销事由之日起一年内，向法院或仲裁机构申请撤销合同。这种情况下，提异议是有效的，且一旦合同被撤销，将自始不具有法律效力。
对合同条款理解存在分歧：
- 若双方只是对房屋买卖协议中的部分条款理解不一致，并未达到可撤销的程度，那么可以通过友好协商的方式解决。例如，双方可以签订补充协议，进一步明确条款的具体含义。若协商无果，任何一方均可考虑通过法律途径，如提起诉讼或申请仲裁，来解决分歧。在这种情况下，提异议本身并不直接导致合同无效，但可以通过法律程序来寻求对合同条款的合理解释或修改。
二、提异议时需注意的事项
及时采取行动：
- 一旦发现房屋买卖协议存在问题或对合同条款有异议，应及时采取合理措施，避免因拖延而让自身权益受损。例如，在知道或应当知道撤销事由之日起一年内提出撤销申请，否则可能丧失撤销权。
准备相关证据：
- 在提异议或申请撤销合同的过程中，需要准备好相关证据来支持自己的主张。这些证据可能包括合同文本、沟通记录、证人证言等。证据的充分性和真实性对于法院或仲裁机构作出公正裁决至关重要。
遵循法律程序：
- 提异议或申请撤销合同需要遵循法律程序。例如，需要向有管辖权的法院或仲裁机构提交申请，并按照规定的格式和要求填写申请书。同时，还需要缴纳相应的诉讼费用或仲裁费用。
三、法律后果
- 若法院或仲裁机构认定房屋买卖协议存在可撤销事由，并裁定撤销合同，那么合同将自始不具有法律效力，双方需要恢复原状或根据实际情况进行赔偿。
- 若法院或仲裁机构认定双方对合同条款的理解存在分歧，但并未达到可撤销的程度，那么可能会根据法律法规和证据对合同条款进行合理解释或修改，以维护双方的合法权益。
建议：在签订房屋买卖协议前，务必仔细阅读合同条款，确保理解并同意其中的内容。若对合同条款有疑问或异议，应及时与对方沟通并寻求专业法律意见。若发现合同存在问题或对合同条款有异议，应及时采取合理措施来维护自己的权益。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。