三兄弟拥有一栋房子但持有三张房产证的情况是否合法，需分情况讨论：

1. 合法情况：

   • 产权分割明确：若该栋房子在物理结构上可以被明确分割成三个独立的部分（如三层楼，每层独立出入、有独立使用功能），且三兄弟通过合法途径（如继承、赠与、买卖等）各自获得了其中一部分的产权，并依法办理了房产证，那么这种情况是合法的。每个房产证对应一个独立的产权单元，符合“一物一权”原则。
   • 共有产权的特殊约定：在某些特殊情况下，三兄弟可能通过协议约定对整栋房子享有共有产权，但出于管理、使用或贷款等需要，分别办理了房产证。这种情况下，虽然有三张房产证，但实质上是对共有产权的一种特殊管理方式，需确保相关协议合法有效，且不违反法律法规的强制性规定。

2. 不合法情况：

   • 重复办证：如果整栋房子无法在物理结构上被明确分割成三个独立的部分，或者三兄弟并未通过合法途径获得各自的产权，而是出于某种目的（如规避税费、骗取贷款等）重复办理了房产证，那么这种情况是不合法的。这违反了“一物一权”原则，即一个物上只能存在一个所有权，房产证作为所有权的证明，不应重复发放。
   • 违规操作：在办理房产证的过程中，如果存在伪造材料、虚假申报等违规行为，那么即使最终获得了房产证，也是不合法的。这些行为不仅违反了房地产管理法律法规，还可能构成犯罪。

法律建议：

• 对于三兄弟来说，如果确实拥有一栋房子并希望各自持有房产证，应首先确保房子的物理结构可以被明确分割成独立的部分，或者通过合法途径明确各自的产权份额。
• 在办理房产证的过程中，应严格遵守相关法律法规和程序要求，确保所有材料的真实性和合法性。
• 如果对房产证的办理存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师或房地产管理部门，以避免因违规操作而引发的法律风险。

可能后果：

• 如果三兄弟持有的三张房产证存在不合法情况，可能会面临房产证被撤销、行政处罚甚至刑事责任等后果。
• 此外，不合法持有的房产证还可能影响房子的买卖、继承等后续法律行为的效力。

因此，三兄弟在拥有一栋房子并希望各自持有房产证时，应谨慎处理相关事宜，确保合法合规。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。