违法建筑的承包人在一定条件下可以主张工程款，但具体能否成功主张取决于工程质量、合同有效性及法律法规的具体规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、合同效力与违法性
合同无效性原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。违法建筑本身违反了法律法规的强制性规定，因此基于违法建筑所签订的施工合同也往往被认定为无效。但这并不意味着承包商完全丧失主张工程款的权利，而是需要依据具体情况进一步判断。
过错责任原则：
- 在合同无效的情况下，双方应根据各自的过错程度承担相应的责任。对于违法建筑的施工，承包商和发包方通常都存在过错，因为双方都明知或应知该建筑为违法建筑而仍然进行建设。然而，这并不影响承包商在工程质量合格的前提下主张工程款的权利。
二、工程质量与工程款主张
已完工程质量合格：
- 依据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定，即使合同无效，只要建设工程经验收合格，承包商仍可参照合同约定主张工程价款。这是因为承包商已投入人力、物力，其劳动成果应得到相应补偿。
- 举例说明：假设一个违法建筑项目，虽然建筑本身违法，但承包商按照合同约定完成了施工任务，且工程质量经验收合格。在这种情况下，承包商有权主张工程款。
已完工程质量不合格：
- 若工程质量不合格，承包商需承担修复责任。修复后验收合格的，仍可主张工程款，但修复费用由承包商自行承担。修复后仍不合格的，承包商则无权主张工程款，因其未履行合同约定的质量要求。
- 举例说明：如果承包商完成的违法建筑项目存在质量问题，且无法修复或修复后仍不合格，那么承包商将无法主张工程款。
三、特殊情况下的处理
合同条款与法律规定：
- 工程款的主张还受合同条款及具体法律规定的约束。即便建筑违法，但基于合同关系产生的债权，在合同有效（尽管建筑违法，但合同其他部分可能有效）且承包商已完成约定任务的前提下，理论上他们有权要求支付款项。然而，实际情况需结合具体法律法规和案件情况综合判断。
政府政策与行政处罚：
- 违法建筑承包商可能面临行政处罚，如责令停止建设、罚款、限期拆除等。这些处罚可能影响承包商的财务状况和主张工程款的能力。同时，如果承包商因违约导致工程无法完成或质量不合格，还需承担违约责任。
- 举例说明：如果政府决定对违法建筑进行拆除，且承包商无法证明其工程款主张与拆除行为无关，那么其工程款主张可能会受到一定影响。
四、综合建议
确保合法合规：
- 承揽工程前，承包商应确保自身具备相应资质，并严格遵守法律法规，以避免法律风险。这是主张工程款的基础和前提。
签订书面合同：
- 明确双方权利义务，特别是工程款的支付方式和时间。这有助于在后续纠纷解决中提供法律依据。
及时验收与结算：
- 工程完工后，应及时进行验收和结算。这有助于确保工程款的及时支付，减少纠纷发生的可能性。
关注政府政策：
- 了解并关注当地政府对违法建筑的具体处理政策和措施。这可能对承包商主张工程款产生直接影响。
寻求专业法律帮助：
- 在处理与违法建筑相关的工程款主张问题时，建议承包商及时咨询专业律师，以获取专业的法律意见和支持。
总结来说，违法建筑的承包人在主张工程款时，需综合考虑合同效力、工程质量、法律法规以及政府政策等多重因素。通过确保合法合规、签订书面合同、及时验收与结算以及寻求专业法律帮助等措施，可以有效维护自身的合法权益。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。