违法建筑承包人通常不能主张利润，以下从多个角度进行分析：
一、法律基础与原则
合同无效性：根据《中华人民共和国民法典》第一百五十三条，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。违法建筑本身违反了法律法规的强制性规定，因此，基于违法建筑所签订的施工合同也往往被认定为无效。合同无效意味着双方基于合同所约定的权利义务关系不再受法律保护，承包人不能依据无效合同主张利润。
过错责任原则：在合同无效的情况下，双方应根据各自的过错程度承担相应的责任。对于违法建筑的施工，承包商和发包方通常都存在过错，因为双方都明知或应知该建筑为违法建筑而仍然进行建设。因此，承包人不能因其过错行为而获得利润。
二、利润主张的限制
折价补偿原则：虽然合同无效，但考虑到承包商的实际投入和劳动成果，法院可能会根据案件具体情况，判决发包方对承包商的实际损失进行折价补偿。然而，这种补偿并非基于有效的合同关系，而是基于公平原则和防止不当得利的目的。在折价补偿时，法院通常会扣除承包商的预期利润部分，仅对其实际成本（如材料费、人工费等）进行合理补偿。
不支持利润请求的司法实践：在司法实践中，法院通常不支持违法建筑承包人主张利润的请求。这是因为违法建筑的建设本身就是违法的，承包人不应从中获得非法利益。如果允许承包人主张利润，将违背法律的原则和精神，也可能引发更多的违法建筑建设行为。
三、特殊情形下的处理
尽管在大多数情况下，违法建筑承包人不能主张利润，但在某些特殊情形下，如工程经竣工验收合格且已交付使用，或者虽未经验收但发包方擅自使用后，承包商可能有机会主张相应的工程款（但通常也不包括利润部分）。然而，这并不意味着所有违法建筑的承包商都能主张工程款或利润，具体还需根据案件事实和法律规定来判断。例如，如果承包商在签订合同时不知晓建筑为违法建筑，且已按照合同约定完成了施工任务并交付使用，那么法院可能会考虑支持其合理的工程款请求（但仍可能扣除利润部分）。但如果承包商明知或应知建筑为违法建筑而仍然进行施工，那么其工程款和利润请求很可能会被驳回。
建议：作为承包人，在承接工程时，应严格审查工程的合法性，避免承接违法建筑的建设任务。如果已经承接了违法建筑的建设任务，应及时与发包方协商解决，避免陷入法律纠纷。如果确实无法避免法律纠纷，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以便更好地维护自己的合法权益。
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