针对您提出的“船公司不同意船员休假应该怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，船员与船公司之间的休假争议，本质上属于劳动争议范畴。在处理此类问题时，船员应首先了解并依据相关的法律法规来维护自己的合法权益。
一、沟通协商
尝试内部沟通：船员可以先尝试与船公司进行直接沟通，明确表达自己的休假需求和理由，看是否能够通过协商达成一致。
寻求上级或人力资源部门帮助：如果直接沟通无果，船员可以向上级领导或人力资源部门反映情况，请求他们介入协调。
二、投诉与举报
向海事管理机构投诉：如果船公司拒绝船员休假且涉及中国籍船舶，船员可以向船舶和机构所在地海事管理机构投诉。投诉时，应提供详细的证据和情况说明，以便海事管理机构进行调查和处理。
向劳动监察部门举报：船员还可以向当地的劳动监察部门举报船公司的违法行为。劳动监察部门有权对用人单位的劳动用工行为进行监督检查，并依法处理违法行为。
三、法律途径
申请劳动争议仲裁：如果沟通协商和投诉举报均无法解决问题，船员可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会将依法对争议进行裁决，船员应按照仲裁结果执行。
提起诉讼：如果对仲裁结果不满意，船员还可以在法定期限内向海事法院提起诉讼。在诉讼过程中，船员需要提供充分的证据来支持自己的主张，并遵循法院的审理程序。
四、注意事项
保留证据：在整个过程中，船员应妥善保留与休假争议相关的所有证据，如劳动合同、休假申请记录、沟通记录等。这些证据将在后续的投诉、仲裁或诉讼过程中发挥重要作用。
了解法律法规：船员应了解并熟悉与劳动争议相关的法律法规，如《中华人民共和国劳动合同法》、《中华人民共和国海商法》等。这将有助于船员更好地维护自己的合法权益。
寻求专业帮助：如果船员在处理休假争议过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师或法律援助机构的帮助。他们将提供专业的法律意见和指导，帮助船员解决问题。
综上所述，当船公司不同意船员休假时，船员可以通过沟通协商、投诉举报、法律途径等多种方式来维护自己的合法权益。在整个过程中，船员应保留证据、了解法律法规并寻求专业帮助。