建筑施工企业对管理人员违章指挥进行罚款的合法性需分情况讨论，具体如下：
一、从法律法规角度分析
直接罚款的合法性存疑
- 根据《建筑法》第七十一条，对于建筑施工企业管理人员违章指挥、强令职工冒险作业的行为，法律主要规定了“依法追究刑事责任”的后果，并未明确赋予企业直接对管理人员进行罚款的权力。
- 《山东省安全生产条例》第四十五条虽然规定了对于违章指挥等行为的处罚措施，但这些措施主要是针对生产经营单位（即企业）本身，要求其限期改正、停产停业整顿，并处以罚款，同时对其直接负责的主管人员或其他直接责任人员处以罚款。这并不意味着企业可以直接对管理人员进行罚款。
企业罚款权的限制
- 一般情况下，企业并不具备对员工进行罚款的法定权力。罚款作为一种行政处罚手段，通常只能由具有行政处罚权的行政机关行使。
- 企业可以通过内部规章制度对员工的行为进行规范和管理，但这些规章制度必须符合法律法规的规定，且不得侵犯员工的合法权益。
二、从企业内部管理角度分析
内部规章制度的合法性
- 如果建筑施工企业希望通过内部规章制度对管理人员违章指挥的行为进行处罚，那么这些规章制度必须经过合法的程序制定，并明确告知员工。
- 规章制度中的处罚措施必须合理、合法，不得违反法律法规的强制性规定，也不得侵犯员工的合法权益。
替代性管理措施
- 建筑施工企业可以通过其他方式来管理管理人员的违章指挥行为，如进行警告、记过、降职等纪律处分，或者通过培训、教育等方式提高管理人员的安全意识和法律意识。
三、法律建议
完善内部管理制度
- 建筑施工企业应完善内部管理制度，明确管理人员违章指挥的认定标准和处罚措施，确保这些措施合法、合理。
加强法律培训和宣传
- 企业应加强对管理人员的法律培训和宣传，提高他们的安全意识和法律意识，减少违章指挥行为的发生。
寻求法律支持
- 如果建筑施工企业认为有必要对管理人员违章指挥的行为进行处罚，但又不确定处罚措施的合法性，可以寻求专业律师的法律支持，确保处罚措施合法、有效。
后续行动建议：如果你作为建筑施工企业的管理人员或员工，遇到了类似的问题，建议首先查阅企业的内部规章制度，了解对于违章指挥行为的处罚措施。如果认为这些措施不合法或不合理，可以向企业提出异议或寻求法律支持。如果有任何法律问题，也可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。