核心结论：协议中约定“共同抚养”且男方支付抚养费的情况下，抚养权的归属及具体安排需结合协议条款、双方实际履行情况及法律规定综合判断，具体可分为以下两种情形：
1. 若协议明确约定抚养权归属，则以协议为准
- 法律逻辑：根据《民法典》第1084条，离婚后子女抚养权归属可由父母协商确定；协商不成的，由法院根据子女权益和双方具体情况判决。若协议已明确约定抚养权归属（如归一方直接抚养，另一方享有探视权），则该约定具有法律效力，双方应按协议履行。
- 共同抚养的体现：协议中“共同抚养”的表述可能指双方共同参与子女成长（如协商教育、医疗等重大事项），但抚养权仍可能归一方所有，另一方通过支付抚养费、定期探视等方式履行抚养义务。
- 示例：若协议约定“子女由女方直接抚养，男方每月支付抚养费3000元，双方共同参与子女教育决策”，则抚养权归女方，男方通过支付费用和参与决策实现共同抚养。
2. 若协议未明确抚养权归属，则需通过补充协议或诉讼确定
- 法律风险：若协议仅笼统约定“共同抚养”但未明确具体权利义务（如直接抚养方、探视时间、费用分担等），可能导致履行争议。此时，双方可协商补充协议；协商不成的，任何一方可向法院起诉，由法院根据子女年龄、父母抚养条件等因素判决抚养权归属。
- 法院判决考量因素：根据《民法典》及相关司法解释，法院会优先保障子女利益，综合考量父母抚养能力（如经济条件、居住环境）、子女生活习惯（如长期随哪方生活）、子女意愿（8周岁以上）等因素。
- 示例：若双方均主张抚养权，且子女已满8周岁表示愿随母亲生活，法院可能判决抚养权归母亲，父亲支付抚养费并享有探视权；若父亲经济条件显著优于母亲，且能提供更稳定的生活环境，法院也可能判决抚养权归父亲。
实务建议
- 完善协议条款：建议在协议中明确抚养权归属、直接抚养方的具体权利义务、非直接抚养方的探视权及抚养费支付方式（金额、时间、调整机制等），避免后续争议。
- 保留履行证据：双方应保留支付抚养费、参与子女生活的证据（如转账记录、探视照片、沟通记录等），以证明实际履行情况。
- 及时解决争议：若发生抚养权争议，应优先通过协商或调解解决；协商不成的，及时向法院起诉，避免长期争议对子女造成不利影响。
提示：抚养权安排需以子女利益为核心，兼顾父母实际情况。如有具体协议条款或案件细节需进一步分析，可直接向我咨询。