政府工程在采购时，是适用《采购法》还是《招投标法》，主要取决于具体的采购方式和内容。以下是对这一问题的详细分析：

1. 招标方式下的法律适用

   • 当政府工程采购采用招标方式进行时，根据《中华人民共和国政府采购法》第四条的规定，应适用《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例。这是因为《招标投标法》针对工程建设项目的招标投标活动制定了更为具体和专业的规定，能够确保工程招标投标活动的规范性和有序性。在招标公告的发布、招标文件的编制、投标、开标、评标、定标等各个环节，都应严格遵循《招标投标法》的相关规定。

2. 非招标方式下的法律适用

   • 政府工程采购并不仅限于招标这一种方式。《政府采购法》第二十六条明确列出了包括公开招标、邀请招标、竞争性谈判、单一来源采购、询价等多种采购方式。对于采用非招标方式（如竞争性谈判、单一来源采购等）进行的政府工程采购，则不适用《招标投标法》，而应遵循《政府采购法》及其相关条例的规定。这些规定涵盖了政府采购的政策、原则、方式、程序等各个方面，确保政府采购活动的公开、公平、公正和高效。

3. 两部法律的特殊关系与补充适用

   • 尽管在招标方式下主要适用《招标投标法》，但在某些特定情况下，如涉及政府采购政策功能（如环保、扶持不发达地区等）、采购合同管理（如合同变更限制、补充合同金额限制等）以及质疑与投诉处理等方面，仍需遵循《政府采购法》及其实施条例的补充规定。这些特殊要求旨在保障政府采购活动的整体规范和政策目标的实现。

4. 实际操作中的注意事项

   • 在实际操作中，政府工程采购应严格按照相关法律法规的规定执行。对于采用招标方式进行的采购，应确保招标活动的公开、公平、公正，并严格遵守《招标投标法》的程序要求。对于采用非招标方式进行的采购，则应遵循《政府采购法》的相关规定，确保采购活动的合法性和规范性。同时，无论采用哪种方式，都应关注政府采购的政策功能，确保采购活动符合国家的经济和社会发展政策目标。

总结来说，政府工程在采购时，若采用招标方式，则主要适用《招标投标法》；若采用非招标方式，则主要适用《政府采购法》。在实际操作中，应综合考虑两部法律的规定，确保采购活动的合法性和规范性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。