针对工程款结算有争议的问题，以下是我从多个角度给出的详细解答和建议：
一、首要解决途径：协商与调解
自行协商：
- 重要性：自行协商是解决工程款结算争议的首选方式，它高效、经济且灵活。
- 操作步骤：承包方和发包方应直接沟通，明确各自立场和诉求，如工程量、计价方式、额外工作内容及费用等。在沟通基础上，寻找共同点，提出解决方案，如重新测量核算争议工程量、调整计价标准等。协商成功后，务必签订书面协议，明确关键条款，以固化协商成果。
第三方调解：
- 适用情况：当自行协商无法达成一致时，可考虑引入第三方调解。
- 调解方式：可以选择人民调解委员会进行调解，他们依据法律法规和情理，引导双方达成和解协议，程序简便、成本低。或者选择行业协会进行调解，利用行业规则和惯例，从专业角度协调纠纷，更具针对性和权威性。
二、行政介入途径：政府协调与投诉
- 适用情况：对于涉及政府投资或国有资金的工程项目，或者纠纷涉及违反行政管理规定时，可向相关行政主管部门求助。
- 操作步骤：向住房和城乡建设部门投诉发包方拖欠工程款、不按规定结算等违法行为。根据纠纷具体情况，也可向市场监督管理部门、税务部门等相关部门投诉。这些部门将依据法规政策对结算争议进行调解，推动问题有效解决。
三、法律解决途径：仲裁与诉讼
仲裁：
- 适用前提：双方需在合同中约定仲裁条款或纠纷发生后达成仲裁协议。
- 仲裁特点：仲裁以其专业性、高效性、保密性及终局性著称，是解决工程结算争议的理想选择。
- 仲裁程序：提交仲裁申请，仲裁庭审理并作出裁决，裁决具有终局性，可申请强制执行。
诉讼：
- 准备材料：起诉状、证据材料（合同、工程验收报告、工程量清单、发票等）。
- 诉讼流程：立案、审理、判决。法院根据查明事实和法律规定作出判决，判决具有权威性和强制性，可申请强制执行。在诉讼过程中，证据的收集与提交至关重要，务必确保证据的完整性和真实性。
四、专业鉴定与评估
- 工程造价鉴定：当双方对工程量计算、计价依据存在重大分歧时，可委托具有资质的造价咨询机构进行司法鉴定。鉴定报告需经法庭质证后方可作为有效证据。
- 质量责任认定：若因工程质量问题引发结算争议，需通过质量检测机构出具专业报告，根据检测结果划分责任归属。
五、综合建议与预防措施
- 合同条款明确性：在签订合同时，应确保合同条款明确、具体，减少歧义和争议点。特别是关于工程款结算的条款，应详细规定计价方式、付款条件、变更签证流程等关键内容。
- 优先协商解决：在争议发生时，保持冷静理性，优先通过协商解决问题。协商过程中，应寻求双赢方案，避免矛盾激化。
- 收集证据：在采取任何法律手段前，务必收集齐全相关证据，以支持自身主张。证据包括合同文件、施工图纸、变更通知、竣工资料、审计报告等。
- 选择适当途径：根据纠纷性质和实际情况，选择最合适的解决途径。对于简单争议，可优先选择协商或调解；对于复杂争议，可考虑仲裁或诉讼。
六、特殊情形处理建议
- “黑白合同”问题：严格遵循相关司法解释规定，以备案的中标合同作为结算依据。
- 审计争议应对：明确合同约定是否以政府审计结果为结算依据。对审计结论有异议时，可申请行政复议或提起行政诉讼。
- 优先受偿权行使：在法定期限内主张建设工程价款优先受偿权，确保债权范围包含利息、违约金等从权利。
综上所述，工程款结算争议的解决需综合考虑多种途径与方法。双方应根据具体情况灵活选择最适合的解决方式，以确保争议得到公正、高效、和谐的解决。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。