狗贩子与宠物店之间的合作协议，在符合法律规定且双方意思表示真实的情况下，是有效的。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、协议有效的法律基础
意思表示真实：
- 协议双方（狗贩子与宠物店）必须基于真实意愿签订协议，不存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形。若一方以虚假信息诱导另一方签订协议，则该协议可能因意思表示不真实而被认定为无效。
内容合法：
- 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，协议中不得约定非法交易、虐待动物等违法内容。若协议内容违法，则整个协议将被认定为无效。
形式合规：
- 虽然口头协议在某些情况下也具有法律效力，但为了避免纠纷和证明协议的存在及内容，建议双方采用书面形式签订协议。书面协议可以更清晰地记录双方的权利和义务，便于在发生纠纷时作为证据使用。
二、协议可能无效的情形
主体不适格：
- 若狗贩子或宠物店不具备签订协议的主体资格，如未取得相关营业执照或经营许可，则该协议可能因主体不适格而被认定为无效。
内容违法或违背公序良俗：
- 如前所述，若协议内容违反法律、行政法规的强制性规定或违背公序良俗，则整个协议将被认定为无效。例如，协议中约定交易来源不明的犬只或进行非法繁殖等行为。
存在欺诈、胁迫等情形：
- 若一方在签订协议时存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形，导致另一方在违背真实意愿的情况下签订协议，则受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。
三、法律建议
审查主体资格：
- 在签订协议前，双方应审查对方的主体资格，确保对方具备签订协议的主体资格和经营许可。
明确协议内容：
- 协议中应明确双方的权利和义务，包括交易犬只的品种、数量、价格、交付方式、质量保证等条款。同时，应避免约定违法或违背公序良俗的内容。
采用书面形式：
- 为了避免纠纷和证明协议的存在及内容，建议双方采用书面形式签订协议，并由双方签字或盖章确认。
寻求法律帮助：
- 若在签订或履行协议过程中遇到法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。
如有任何关于合同纠纷或侵权损害的法律问题，可以直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。