在军事管理区擅自收纳建筑垃圾属于违法行为，将可能面临责令限期清除、罚款等行政处罚。具体分析如下：
一. 法律依据
《中华人民共和国军事设施保护法》第三十条：军事禁区、军事管理区的管理单位应当采取必要措施，保护军事设施的安全，防止军事设施受到破坏、危害。任何组织或者个人不得破坏、危害军事设施。
《中华人民共和国军事设施保护法》第四十三条：有下列行为之一的，适用《中华人民共和国治安管理处罚法》第二十三条的处罚规定：（一）非法进入军事禁区、军事管理区的；（二）对军事禁区、军事管理区非法进行摄影、摄像、录音、勘察、测量、描绘和记述的；（三）进行破坏、危害军事设施活动的。其中，《中华人民共和国治安管理处罚法》第二十三条规定，有上述行为之一的，处警告或者二百元以下罚款；情节较重的，处五日以上十日以下拘留，并处五百元以下罚款。
《城市建筑垃圾管理规定》第二十条：任何单位和个人有下列情形之一的，由城市人民政府市容环境卫生主管部门责令限期改正，给予警告，处以罚款：（一）将建筑垃圾混入生活垃圾的；（二）将危险废物混入建筑垃圾的；（三）擅自设立弃置场受纳建筑垃圾的。单位有前款第一项、第二项行为之一的，处3000元以下罚款；有前款第三项行为的，处5000元以上1万元以下罚款。个人有前款第一项、第二项行为之一的，处200元以下罚款；有前款第三项行为的，处3000元以下罚款。
虽然《城市建筑垃圾管理规定》中未直接提及军事管理区，但结合《中华人民共和国军事设施保护法》，在军事管理区内擅自收纳建筑垃圾显然违反了保护军事设施安全的规定，且属于“擅自设立弃置场受纳建筑垃圾”的情形。
二. 处罚措施
三. 总结
综上所述，擅自在军事管理区收纳建筑垃圾是违法的，不仅违反了军事设施保护的相关法律，也违反了城市建筑垃圾管理的规定。违法者将面临责令限期清除和罚款等行政处罚。我建议相关单位和个人应严格遵守法律法规，不得在军事管理区内擅自收纳建筑垃圾，以维护军事设施的安全和城市环境的整洁。如有进一步需要，您可以继续咨询我。