结论前置：

1. 车贷抵押5万本金，期限4年，年利率13.88%，从现行法律规定来看，该利率水平本身并不违法。
2. 但需注意，实际利率是否合法还需考虑贷款机构是否具备合法资质、是否明确告知利率及费用、是否存在其他不合理费用等因素。

法律分析：

首先，我们需要明确的是，关于贷款利率的合法性，主要依据的是《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》以及中国人民银行的相关规定。虽然这些规定主要针对的是民间借贷，但金融机构的贷款利率也需遵循类似的公平、合理原则，且不得违反国家关于利率上限的规定。

1. 利率水平合法性：

   • 根据现行法律，对于金融机构的贷款利率，并没有一个固定的上限数字，而是要求利率应当合理、公平，不得违反国家关于利率管理的相关规定。年利率13.88%在当前市场环境下，并不属于极端高利贷范畴，因此从利率数字本身来看，并不违法。

2. 贷款机构资质与合规性：

   • 除了利率水平外，贷款机构的资质和合规性也是判断贷款合法性的重要因素。如果贷款机构不具备合法放贷资质，或者存在欺诈、隐瞒等违法行为，那么即使利率水平看似合法，整个贷款行为也可能被视为非法。

3. 利率及费用的明确告知：

   • 贷款机构在放贷前，应当明确告知借款人贷款的利率、费用以及还款方式等关键信息。如果贷款机构未履行告知义务，或者故意隐瞒重要信息，导致借款人误解或受损，那么该贷款行为也可能存在法律问题。

4. 其他不合理费用：

   • 除了利率外，贷款机构还可能收取一些其他费用，如手续费、管理费等。这些费用的收取也需遵循合理、公平的原则，不得存在乱收费、高收费等违法行为。

具体计算与说明：

• 假设贷款本金为5万元，期限为4年，年利率为13.88%，则按照等额本息还款法计算，每月还款额可以通过贷款计算器或相关公式得出（此处不展开具体计算过程）。重要的是要理解，这个利率水平在法律上并不构成高利贷，但借款人仍需关注贷款机构的整体合规性和费用透明度。

建议与后续行动：

• 如果您正在考虑接受这样的车贷抵押，建议您首先确认贷款机构的合法资质和信誉度。
• 仔细阅读贷款合同，确保所有条款（包括利率、费用、还款方式等）都清晰明确，没有隐藏条款或不合理之处。
• 如有任何疑问或不确定之处，及时向贷款机构咨询并要求解释清楚。
• 如果发现贷款机构存在违法行为或不合理收费，可以向相关监管部门投诉或寻求法律援助。

总结： 车贷抵押5万本金，期限4年，年利率13.88%，从利率数字本身来看并不违法。但判断贷款合法性还需考虑贷款机构的资质、合规性、利率及费用的明确告知以及其他不合理费用等因素。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。