针对您提出的“小区里面的住家别墅卖一层证件需要怎么办理以及是否合法”的问题，我将结合相关法律法规和实际情况，为您进行详细解答。

首先，关于“卖一层证件”这一表述，我理解您可能是想询问关于将别墅中的一层作为独立产权进行出售或转让的相关手续和合法性。在大多数情况下，别墅作为整体产权的私有房屋，其各层并不单独具备独立的产权证书。若要将其中一层进行出售或转让，实际上涉及的是别墅产权的分割或部分转让问题。

一、合法性分析

1. 产权分割的合法性：根据《城市私有房屋管理条例》及相关法律法规，城市私有房屋的产权分割需符合法律法规的规定，并经过相关部门的审批。若别墅的产权分割未经合法程序，擅自进行出售或转让，可能构成违法行为。

2. 相邻权与共有权：别墅作为整体产权，其各层之间可能存在相邻权和共有权的问题。若要将其中一层进行出售或转让，需确保不损害其他共有人的合法权益，并征得他们的同意。

二、办理流程

若您确实需要将别墅中的一层进行出售或转让，且该行为符合法律法规的规定，您可以按照以下流程进行办理：

1. 咨询相关部门：首先，建议您咨询当地的房地产管理机关或相关部门，了解别墅产权分割或部分转让的具体政策和要求。

2. 准备相关材料：根据相关部门的要求，准备必要的材料，如房屋所有权证、身份证明、共有权人同意书等。

3. 提交申请并办理手续：将准备好的材料提交给相关部门，并按照他们的要求办理产权分割或部分转让的手续。这可能包括填写申请表、缴纳相关税费、进行产权登记等。

4. 领取新的产权证书：在办理完所有手续后，您将领取到新的产权证书，该证书将明确记载您所拥有的别墅部分的产权信息。

三、特别提醒

1. 谨慎操作：别墅产权的分割或部分转让涉及复杂的法律关系和权益问题，建议您在操作前咨询专业的法律人士或房地产经纪人，以确保您的权益得到保障。

2. 遵守法律法规：在整个过程中，您必须严格遵守相关的法律法规和政策要求，不得擅自进行违法操作或损害他人的合法权益。

3. 考虑相邻关系：在办理产权分割或部分转让时，您还需考虑与相邻住户的关系问题，确保不会因您的行为而给他们带来不便或损害。

综上所述，将别墅中的一层进行出售或转让并非简单的事情，需要您仔细考虑并遵循相关的法律法规和政策要求。若您对此仍有疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地的房地产管理机关或相关部门。