在案发前已归还的贪污款项，一般不计入最终的贪污数额认定，但需结合具体情形判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律原则层面

根据我国《刑法》及相关司法解释，贪污罪的成立要求行为人具有非法占有公共财物的目的，并通过贪污行为实际控制了公共财物。若行为人在案发前已主动归还贪污款项，表明其主观上非法占有的目的已发生动摇或消除，且客观上未实际长期占有公共财物，因此一般不计入贪污数额。这一原则体现了刑法对主观恶性与客观危害的综合考量，旨在区分真正的贪污犯罪与一时贪念后的悔过行为。

二、具体情形分析

1. 主动归还且未造成损失
   若行为人在贪污后、案发前主动归还全部款项，且未给国家或集体造成实际损失，司法实践中通常不认定为贪污既遂，也不计入贪污数额。例如，某公务员因一时贪念将单位公款转入个人账户，但次日即主动归还，未使用该款项，此类行为可能被认定为贪污未遂或情节显著轻微，不构成犯罪。

2. 被动归还或部分归还

   • 被动归还：若行为人因被调查、审计或他人举报而被迫归还款项，虽可能减轻处罚，但已实际占有的款项仍可能被计入贪污数额。例如，某官员在审计期间归还部分贪污款项，但此前已长期占有并使用，此类行为可能被认定为贪污既遂，归还部分仅作为量刑情节考虑。
     
   • 部分归还：若行为人仅归还部分款项，未归还部分仍会被计入贪污数额。例如，贪污100万元后归还50万元，剩余50万元仍需承担贪污责任。

3. 归还后继续贪污
   若行为人归还后又再次实施贪污行为，每次贪污均需独立评价，归还前次款项不影响后次行为的定性。例如，某官员第一次贪污50万元后归还，第二次又贪污30万元，两次行为均需分别认定贪污数额。

三、法律后果与建议

1. 法律后果

   • 不计入贪污数额的情形：主动归还且未造成损失的，可能不构成犯罪或仅作为情节轻微处理。
     
   • 计入贪污数额的情形：被动归还、部分归还或归还后继续贪污的，已实际占有的款项仍会被追究刑事责任，但归还行为可能作为从轻或减轻处罚的情节。

2. 建议

   • 及时主动归还：若已实施贪污行为，应尽快主动归还全部款项，并主动向单位或纪检监察机关说明情况，争取从宽处理。
     
   • 保留证据：归还时应保留转账记录、书面说明等证据，以证明归还的主动性与及时性。
     
   • 咨询专业律师：若涉及复杂情形（如部分归还、被动归还等），建议及时咨询专业律师，制定辩护策略，最大限度维护合法权益。

总结：案发前已归还的贪污款项是否计入数额，需结合归还的主动性、及时性及是否造成损失等因素综合判断。主动归还且未造成损失的，一般不计入；被动归还或部分归还的，仍可能被追究责任。如有具体案件或疑问，可直接向我咨询，我将结合案情为您提供专业法律意见。