厂房报规后降低厂房高度是否合法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：

1. 规划许可的约束性：

   • 厂房报规，即向相关部门申请并获得建设规划许可，是厂房建设的前提。规划许可中通常会明确厂房的高度、面积、用途等关键参数。
   • 若规划许可中明确规定了厂房的高度，且未允许后续调整，那么在未经重新报规并获得批准的情况下，擅自降低厂房高度可能构成违规建设，面临行政处罚，如罚款、责令整改甚至拆除等。

2. 规划变更的可能性：

   • 若因实际需要（如地质条件变化、设计优化等）确实需要降低厂房高度，应向原审批部门提出规划变更申请，并附上充分的理由和必要的证明材料。
   • 审批部门会根据实际情况进行审查，若认为变更合理且符合相关规划要求，可能会批准变更申请。此时，降低厂房高度便是合法的。

3. 法律后果的考量：

   • 擅自降低厂房高度，除了可能面临行政处罚外，还可能对厂房的使用功能、安全性等产生负面影响，进而引发民事纠纷或刑事责任。
   • 例如，若降低高度导致厂房无法满足原有设计的使用要求，可能构成对合同相对方的违约，需承担违约责任。

建议：

• 在考虑降低厂房高度前，务必先查阅规划许可文件，了解其中关于厂房高度的具体规定。
• 若确实需要变更，应按照法定程序向原审批部门提出申请，并等待批准后再进行施工。
• 在整个过程中，建议咨询专业的规划或法律人士，以确保变更的合法性和合规性。

总结：厂房报规后降低厂房高度是否合法，取决于规划许可的具体规定以及是否按照法定程序进行了规划变更。在做出任何变更前，务必进行充分的法律和规划审查，以避免不必要的法律风险和损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。