结论前置：保险公司是否有权扣除车主垫付给伤者的钱，需分情况讨论，具体如下：
若垫付金额在保险责任范围内且无争议
保险公司通常无权扣除。根据《保险法》及保险合同约定，保险公司应在责任限额内赔偿伤者损失。若车主垫付的金额属于保险赔偿范围（如医疗费、护理费等），且无免责事由（如酒驾、无证驾驶等），保险公司应将垫付款项直接支付给车主或伤者，不得擅自扣除。
例外情形：若车主垫付时未保留有效凭证（如发票、收据），或垫付项目超出保险合同约定的赔偿范围（如非医保用药），保险公司可能要求扣除超支部分。
若垫付金额涉及责任划分争议
保险公司可能暂扣部分款项。例如，交通事故中若存在多方责任（如车主与伤者均有过错），保险公司可能根据责任比例计算赔偿金额，并暂扣超出车主责任比例的垫付款项，待责任认定后多退少补。
法律依据：根据《道路交通安全法》第七十六条，机动车与非机动车、行人之间发生事故，有证据证明非机动车驾驶人、行人有过错的，根据过错程度适当减轻机动车一方的赔偿责任。
若车主未履行合同义务（如未及时报案、未提供材料）
保险公司可能扣除或拒赔。根据保险合同约定，车主需在事故发生后及时报案并提交理赔材料。若因车主拖延导致证据灭失或赔偿金额无法确定，保险公司可能扣除相应款项或拒绝赔偿。
建议：车主应保留垫付凭证（如转账记录、收条），并在事故后48小时内向保险公司报案，配合提供事故认定书、医疗记录等材料。
总结：保险公司是否有权扣除垫付款项，需结合保险合同条款、事故责任认定及垫付凭证的完整性综合判断。若您遇到此类纠纷，可直接向我提供具体案情（如事故责任比例、垫付金额及项目、保险合同条款等），我将进一步为您分析。