违法发布医疗广告的违法所得，在计算时通常不需要扣除成本。以下是对此问题的详细分析：

一、违法所得的计算原则

在法律实践中，违法所得一般指的是因违法行为而获得的全部收入，这通常包括直接收入和间接收入，且在计算时一般不扣除成本。这是因为违法所得的计算旨在惩罚违法行为，而非仅仅针对其利润部分。对于违法发布医疗广告的行为，其违法所得同样遵循这一原则。

二、相关法律法规的依据

虽然具体的法律法规可能并未直接明确规定违法发布医疗广告的违法所得是否需要扣除成本，但根据《中华人民共和国广告法》等相关法律法规的精神，以及违法所得计算的一般原则，可以推断出违法所得的计算通常不包括扣除成本。此外，各地在执行相关法律法规时，也往往遵循这一原则，对违法发布医疗广告的行为进行处罚。

三、实际案例与司法实践

在实际案例中，对于违法发布医疗广告的行为，监管部门通常会根据其违法所得进行罚款。这些罚款的计算往往基于违法行为的全部收入，而非扣除成本后的利润。司法实践中，法院在审理相关案件时，也往往会支持监管部门的这一做法，认为违法所得的计算不应扣除成本。

四、法律后果与建议

对于违法发布医疗广告的行为，除了可能面临罚款外，还可能面临其他法律后果，如责令停止发布广告、消除影响等。因此，建议相关医疗机构和广告发布者严格遵守相关法律法规，避免违法发布医疗广告。如果已经发生了违法行为，应积极配合监管部门的调查和处理，尽快消除不良影响，并采取措施防止类似行为再次发生。

如有任何关于医疗医患领域的法律问题，包括但不限于医疗事故责任及赔偿等，都可以直接向我咨询。