在劳动仲裁过程中，如果提交的证据涉及违反保密协议的情况，这确实是一个需要谨慎处理的问题。以下是我为您提供的详细解答和建议：

一、明确保密协议的内容与范围

首先，您需要仔细审查保密协议的具体条款，明确哪些信息属于保密范畴，以及违反保密协议的具体后果。这有助于您判断所提交的证据是否确实违反了保密协议。

二、评估证据的必要性与风险

在提交证据前，您需要评估这些证据对于劳动仲裁案件的必要性。如果证据对于证明您的主张至关重要，且没有其他替代证据，那么您可能需要考虑提交。但同时，您也要意识到提交违反保密协议的证据可能带来的风险，如对方可能提起反诉或要求赔偿。

三、尝试与对方协商

在提交证据前，您可以尝试与对方进行协商，看是否能够达成某种妥协或解决方案。例如，您可以提出在仲裁过程中不直接展示违反保密协议的证据，而是通过其他方式（如口头描述或概括性说明）来支持您的主张。

四、寻求法律专业意见

由于涉及保密协议和劳动仲裁的复杂性，我强烈建议您在提交证据前咨询专业的法律人士。他们可以根据您的具体情况，提供针对性的法律建议，帮助您权衡利弊，并制定出最合适的策略。

五、如果必须提交，采取保护措施

如果您认为提交违反保密协议的证据是必要的，且没有其他更好的选择，那么您可以考虑采取一些保护措施来降低风险。例如：

1. 申请保密令：在提交证据前，您可以向仲裁机构或法院申请保密令，要求对方不得将证据内容泄露给第三方。
2. 限制证据展示范围：在仲裁过程中，您可以要求仲裁员或法官限制证据的展示范围，仅对必要的人员展示。
3. 签署保密协议：如果可能的话，您可以与对方签署一份额外的保密协议，明确双方在仲裁过程中对证据的保密义务。

六、准备应对可能的后果

最后，您需要做好应对可能后果的准备。如果对方认为您违反了保密协议，并提起了反诉或要求赔偿，您需要积极应对，并准备好相应的证据和论点来支持您的立场。

总之，在劳动仲裁过程中提交违反保密协议的证据是一个需要谨慎处理的问题。我建议您在提交前仔细评估证据的必要性与风险，并尝试与对方协商或寻求法律专业意见。如果必须提交，请采取适当的保护措施来降低风险。