结论前置：公司罚款超过当天工资，在大多数情况下是违法的，但具体是否违法需根据实际情况判断，关键在于公司是否有合法依据和程序进行罚款，以及罚款是否遵循了相关法律法规的规定。

一、法律层面的分析

1. 公司罚款权的法律限制：

   • 公司并非行政机关，不具备法律授予的行政处罚权，因此无权对员工进行罚款作为行政处罚。这一原则在《中华人民共和国行政处罚法》中有明确规定，行政处罚由具有行政处罚权的行政机关实施。

2. 员工赔偿经济损失的法律规定：

   • 根据《工资支付暂行规定》第十六条，若劳动者因本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，并从劳动者工资中扣除。但扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这一规定限制了公司罚款的金额，确保不会因罚款而影响员工的最低生活费用。

二、合同协议与实际情况的考量

1. 合同协议的约定：

   • 员工与雇主之间签订的劳动合同或相关协议中，可能包含关于罚款的具体条款。这些条款应明确罚款的上限、条件及程序等，并确保内容合法、双方自愿签订。然而，即便合同中有罚款条款，也必须遵循上述法律法规的限制，不得超出法定上限或影响员工最低生活费用。

2. 实际情况的合理性判断：

   • 在具体判断罚款是否合理时，还需综合考虑罚款的原因、金额以及员工的经济状况。罚款应与违规行为相匹配，不得过高或过低。同时，罚款不应对员工造成过大的经济负担，影响其正常生活。

三、具体案例与法律后果

• 案例说明：假设某员工因违反公司规定被罚款，且罚款金额超过了其当天工资。若公司无法提供合法依据和程序支持该罚款，且罚款金额违反了《工资支付暂行规定》中关于扣除部分不得超过当月工资20%的限制，则该罚款行为很可能被认定为违法。

• 法律后果：若公司违法罚款，员工有权向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。公司可能面临人力资源社会保障行政部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。

四、建议与行动指南

1. 对于员工：

   • 若认为公司罚款行为违法，首先与公司协商解决，要求公司出示合法依据和程序。
   • 协商不成时，及时向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

2. 对于公司：

   • 在制定规章制度时，确保罚款条款合法、合理，并遵循相关法律法规的限制。
   • 在实施罚款前，确保有合法依据和程序支持，并告知员工相关权利和义务。

总结：公司罚款超过当天工资在大多数情况下是违法的，除非公司有明确的合法依据、遵循了法定程序，并且罚款金额合理且不影响员工的最低生活费用。若您面临具体的罚款问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。