关于城区自建房收取收益金是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来详细分析。以下是我从不同角度给出的分析：

1. 合法性基础：产权与使用权

• 产权清晰：首先，要明确自建房的产权归属。如果自建房的所有权完全属于您，且没有违反任何城市规划、土地使用等相关法律法规，那么您对房屋的使用、收益等权利原则上应受到保护。
• 使用权转让：若您打算将自建房的部分或全部空间出租、出借或以其他方式允许他人使用，并因此收取收益金，这通常被视为使用权的有偿转让。在产权清晰且符合相关规定的前提下，这种转让行为本身是合法的。

2. 合规性审查：地方政策与规定

• 地方性法规：不同地区对于自建房的管理政策可能存在差异。一些城市可能对自建房的出租、经营等行为有特定的限制或要求，如需要办理相关许可证、缴纳税费等。因此，在收取收益金前，务必了解并遵守当地的相关规定。
• 规划与建设合规：自建房的建设必须符合城市规划、建筑安全等标准。如果房屋存在违规建设、安全隐患等问题，可能会影响其合法性，进而影响收益金的收取。

3. 合同与协议：明确双方权利义务

• 书面合同：无论与谁进行收益金的收取安排，都建议签订书面合同或协议，明确双方的权利义务、收益分配方式、违约责任等条款。这有助于保护您的合法权益，避免潜在的纠纷。
• 合法内容：合同内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定。例如，不得约定非法用途、高利贷等条款。

4. 税务与财务：合规纳税

• 税务申报：收取收益金可能涉及税务问题。根据税法规定，您可能需要就这部分收入申报并缴纳相关税费。务必了解并遵守税务法规，避免因偷税漏税而面临法律风险。
• 财务记录：保持良好的财务记录，包括收入、支出等明细，有助于您在需要时提供证明，保护自己的合法权益。

5. 潜在风险与防范

• 纠纷风险：在收取收益金的过程中，可能会遇到与承租人、使用人等之间的纠纷。建议通过协商、调解等方式解决，必要时可寻求法律援助或提起诉讼。
• 法律风险：如果自建房存在产权纠纷、违规建设等问题，可能会面临法律风险。因此，在收取收益金前，务必确保房屋的合法性和合规性。

总结与建议：

• 在产权清晰、符合地方政策与规定的前提下，城区自建房收取收益金通常是合法的。
• 务必了解并遵守当地的相关规定，办理必要的许可证、缴纳税费等。
• 签订书面合同或协议，明确双方的权利义务，保护自己的合法权益。
• 保持良好的财务记录，合规纳税，避免法律风险。
• 如遇纠纷或法律问题，建议及时咨询专业律师（即我本人，薛雯雯律师，专注于公司事务、知识产权、房产纠纷等多个领域），获取专业的法律建议。

如果您有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。