在民事案件中，如果有证据证明被告持有原告的有利证据而拒不提供，原告可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 申请法院责令被告提交证据：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。若原告有合理理由认为被告持有对其有利的证据且拒不提交，原告可以向法院提出申请，请求法院责令被告提交该证据。
   • 法院在审查原告的申请后，若认为有必要，会向被告发出提交证据的命令。若被告无正当理由拒不提交，法院可能会认定原告所主张的证据内容为真实，或者对被告产生不利的法律后果。

2. 利用举证责任分配原则：

   • 在民事诉讼中，举证责任通常遵循“谁主张，谁举证”的原则。然而，在某些特定情况下，法律会规定举证责任倒置，即由被告承担举证责任。若原告能证明被告持有关键证据且该证据对案件结果有重大影响，而被告拒不提供，法院可能会根据案件具体情况，将举证责任分配给被告。
   • 若被告无法提供其应当持有的证据，或者提供的证据不足以证明其主张，法院可能会根据已有证据和案件事实，作出对被告不利的判决。

3. 考虑申请证据保全：

   • 若原告担心被告在诉讼过程中会销毁或隐匿关键证据，原告可以向法院申请证据保全。证据保全是指法院在起诉前或诉讼过程中，对可能灭失或今后难以取得的证据，采取查封、扣押、拍照、录音、录像、复制、鉴定、勘验、制作笔录等方法，予以固定和保护的行为。
   • 通过证据保全，原告可以确保关键证据不被被告破坏或隐匿，从而在诉讼中占据有利地位。

4. 在诉讼中充分阐述被告拒不提交证据的影响：

   • 在诉讼过程中，原告应充分阐述被告拒不提交证据对其诉讼主张的不利影响。原告可以指出，被告作为证据的持有者，有义务提供与案件相关的证据。若被告拒不提供，应视为其放弃了举证权利，或者应承担由此产生的不利后果。
   • 法院在审理案件时，会综合考虑双方当事人的举证情况、证据的证明力以及案件事实等因素，作出公正的判决。

在实际操作中，原告需要注意以下几点：

• 确保自己有充分的证据证明被告持有相关证据：这可以是书面证据、证人证言或其他能够证明被告持有证据的材料。
• 及时向法院提出申请：在发现被告持有关键证据且拒不提交时，原告应及时向法院提出申请，以免错过最佳时机。
• 配合法院的调查和审理工作：在诉讼过程中，原告应积极配合法院的调查和审理工作，提供必要的协助和支持。

若被告的行为构成妨碍民事诉讼的行为，法院还可以对其采取罚款、拘留等强制措施。因此，在面对被告拒不提交证据的情况时，原告应积极采取措施维护自己的合法权益。如果有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。