当员工因违规操作导致事故时，处理过程需要遵循法律法规，并确保工伤认定与赔偿的公正性，同时依据单位规章制度对违规员工进行适当处理。以下是对这一问题的详细解答：

一、事故现场处理与安全保障

1. 首要任务：确保人员生命安全，防止事故扩大。应立即救治伤员，拨打急救电话，并采取必要措施避免二次事故的发生。
2. 现场保护：保持事故现场原状，这对后续调查至关重要。应设置警示标识，安排专人看守，确保现场不受破坏。

二、事故调查与责任认定

1. 成立调查小组：由安全管理部门、工会代表及行业专家组成，全面了解事故经过、原因。
2. 证据收集：包括现场照片、视频、设备运行记录、证人证言等，为准确判断事故原因和责任提供依据。
3. 原因分析：深入分析事故原因，区分是员工违规操作还是其他因素（如设备故障、管理漏洞）。
4. 责任认定：明确员工责任程度，同时考察用人单位在安全培训、规程制定等方面的过错，以确定双方责任。

三、工伤认定与赔偿

1. 无过错原则：根据《工伤保险条例》，无论员工是否违规，只要在工作时间、工作场所因工作原因受伤，均应认定为工伤。
2. 申请流程：用人单位应在30日内向劳动保障行政部门提出工伤认定申请；若未按时申请，员工或其近亲属、工会组织可在1年内自行申请。
3. 劳动能力鉴定：伤情稳定后，由市级劳动能力鉴定委员会进行鉴定，作为赔偿依据。
4. 工伤待遇：包括医疗费、停工留薪期工资、伤残津贴等，具体标准和金额依据法律法规和实际情况确定。

四、对涉事员工的处理

1. 批评教育：对违规员工进行严肃批评，使其认识错误及后果。
2. 纪律处分：根据规章制度给予相应处分，如警告、记过、降职、解除劳动合同等。处分需考虑事故严重程度和员工态度。
3. 经济赔偿：若违规操作造成经济损失，用人单位可要求员工赔偿。具体方式和比例依据劳动合同和规章制度确定。例如，在某些情况下，员工可能需要承担部分或全部因违规操作导致的直接经济损失。

五、法律救济途径与争议解决

在工伤认定、待遇享受或责任追究过程中发生争议，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决，确保双方权益得到保障。

六、案例参考与法规依据

以某公司压铸机作业岗位员工违规操作致骨折为例，当地应急管理部门依据《江苏省安全生产行政处罚裁量权基准》和《安全生产违法行为行政处罚办法》的相关规定，对该企业及其负责人作出了罚款处罚。这表明，员工违规操作不仅可能导致自身受伤，还可能使企业及其负责人面临法律处罚。

七、完善安全管理制度与事故预防

1. 分析漏洞：反思安全管理存在的问题，如培训不到位、规程不完善等。
2. 修订制度：及时修订和完善安全管理制度，加强安全培训和监督检查，提高员工安全意识和操作技能，确保制度有效执行。

综上所述，处理员工因违规操作导致的事故时，应兼顾工伤认定的公正性与对违规行为的处理，同时加强安全管理，预防未来事故的发生。