两人之间写的土地承包协议是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：

一、协议主体资格

1. 合法承包方：根据《农村土地承包法》的相关规定，农村土地承包的承包方是本集体经济组织的农户。若两人均为同一集体经济组织的成员，且具备完全民事行为能力，那么他们之间签订的土地承包协议在主体资格上是合法的。
2. 非法承包方：如果其中一方或双方并非该集体经济组织的成员，或者不具备完全民事行为能力（如未成年人、精神病人等），那么他们签订的土地承包协议可能因主体资格不合法而无效。

二、协议内容合法性

1. 符合法律法规：土地承包协议的内容必须符合《农村土地承包法》及其他相关法律法规的规定。例如，协议中不得有违反法律强制性规定的内容，如改变土地用途、非法转让土地等。
2. 不损害集体利益：协议内容不得损害集体经济组织的利益。如果协议中涉及的土地承包费用过低，或者承包期限过长，可能损害集体经济组织的其他成员的利益，这样的协议可能被认定为无效。

三、协议签订程序

1. 民主议定程序：根据相关规定，土地承包方案的制定和实施应当经过本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意。如果两人之间的土地承包协议未经民主议定程序，可能因程序不合法而无效。
2. 书面形式：土地承包协议应当采用书面形式。如果两人之间只是口头约定，没有签订书面协议，那么在发生纠纷时可能难以证明协议的存在和内容，从而影响协议的效力。

四、实际履行情况

1. 实际履行：如果两人之间的土地承包协议已经实际履行，且双方均无异议，那么在实际操作中，该协议可能被视为有效。但需要注意的是，实际履行并不能完全替代法律上的合法性审查。
2. 未履行或履行争议：如果协议签订后未实际履行，或者双方在履行过程中产生争议，那么协议的合法性就可能成为争议的焦点。在这种情况下，需要依据相关法律法规和协议内容来判断协议的效力。

法律建议

1. 审查协议：在签订土地承包协议前，双方应仔细审查协议内容，确保协议主体资格合法、内容符合法律法规、签订程序合法。
2. 咨询专业人士：如果对协议的合法性存在疑虑，建议咨询专业律师或相关法律机构，以获取更准确的法律意见。
3. 及时处理纠纷：如果协议履行过程中产生纠纷，双方应首先尝试通过协商解决。如果协商无果，可以依法向人民法院提起诉讼或向相关行政部门申请调解、仲裁等。

两人之间写的土地承包协议是否合法，需综合考虑协议主体资格、内容合法性、签订程序以及实际履行情况等多个因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。