针对签过劳动合同的人员病假三个月以上的情况，以下是从不同角度给出的分析和建议：
一、医疗期规定
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》：
- 实际工作年限十年以下的，在本单位工作年限五年以下的为三个月医疗期；五年以上的为六个月医疗期。
- 实际工作年限十年以上的，医疗期根据在本单位的工作年限进一步延长，最长可达二十四个月。
根据地方性规定（如《关于本市劳动者在履行劳动合同期间患病或者非因工负伤的医疗期标准的规定》）：
- 医疗期通常按照劳动者在本用人单位的工作年限设置，首年为3个月，之后每满1年增加1个月，但不超过24个月。
结论：病假三个月以上是否合法或合理，首先取决于员工的实际工作年限和在本单位的工作年限，以确定其应享有的医疗期长度。
二、病假期间的工资待遇
- 根据《关于加强企业职工疾病休假管理保障职工疾病休假期间生活的通知》：
- 职工疾病或非因工负伤连续休假在6个月以内的，企业应按下列标准支付疾病休假工资：连续工龄不满2年的，按本人工资的60%计发；连续工龄满2年不满4年的，按本人工资的70%计发；以此类推，连续工龄满8年及以上的，按本人工资的100%计发。
结论：在病假期间，员工有权获得一定比例的工资，具体比例取决于其连续工龄。
三、劳动合同的处理
医疗期内：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，员工在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。这意味着，即使员工病假超过三个月，只要仍在医疗期内，用人单位就不能单方面解除劳动合同。
医疗期满后：
- 如果员工医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。但在此情况下，用人单位需要支付经济补偿金。
结论与建议：
- 对于员工：如果病假超过三个月，首先应确认自己的医疗期长度。在医疗期内，应安心休养，不必担心劳动合同被解除。医疗期满后，如果仍不能恢复工作，应与用人单位协商解决方案，如调整工作岗位或申请延长医疗期等。
- 对于用人单位：在员工病假期间，应依法支付病假工资，并在医疗期满后，根据员工的实际情况和劳动合同的约定，妥善处理劳动合同关系。如果决定解除劳动合同，应依法支付经济补偿金，并提前通知员工。
四、特殊情况与争议解决
- 如果员工或用人单位对医疗期的长度、病假工资的支付或劳动合同的解除等存在争议，可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径解决。
建议：在处理此类争议时，建议双方保留好相关证据，如医疗证明、工资单、劳动合同等，以便在争议解决过程中维护自己的合法权益。
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