合同因事实上不能履行已经终止，但仍建议进行解除操作。以下从不同角度对此问题进行分析：
一、法律层面分析
合同终止与解除的区别：
- 合同终止通常指的是合同因某种原因（如履行完毕、双方协商一致等）而自然结束，合同关系不再存在。
- 合同解除则是指因一方或双方违约、不可抗力等原因，导致合同无法继续履行或继续履行已无意义，从而通过法律程序或双方协商来提前结束合同关系。
事实上不能履行与合同解除：
- 当合同因事实上不能履行（如标的物灭失、不可抗力等）而终止时，虽然合同关系在事实上已经结束，但法律上仍建议进行解除操作。
- 这是因为，未解除的合同在法律上仍可能被视为有效，双方仍可能受其约束，从而引发不必要的法律纠纷和责任。
法律依据：
- 根据《民法典》第五百六十三条的规定，因不可抗力致使不能实现合同目的等情形，当事人可以解除合同。
- 这意味着，在合同事实上不能履行的情况下，法律赋予了当事人解除合同的权利。
二、实际操作层面分析
避免后续纠纷：
- 解除合同可以明确双方的权利义务关系已经终止，避免后续因合同问题而产生的纠纷和责任。
- 例如，如果合同未解除，一方可能因合同持续存在而被追究未履行义务的责任。
处理已履行部分和损失：
- 解除合同后，双方可以对已履行部分和损失进行处理，如返还财产、折价补偿等，从而保障当事人的合法权益。
- 例如，如果一方已经支付了部分货款，但合同因事实上不能履行而终止，解除合同后可以要求另一方返还已支付的货款。
协商与单方解除：
- 解除合同可以通过双方协商一致的方式进行，也可以通过单方解除的方式（如出现不可抗力等致合同目的无法实现的情形）进行。
- 无论哪种方式，解除合同都是必要的法律程序，以确保双方的权利义务关系得到明确和妥善的处理。
三、建议与风险提示
建议：
- 在合同因事实上不能履行而终止的情况下，建议双方及时进行解除操作，以明确双方的权利义务关系已经终止。
- 解除合同可以通过书面协议的方式进行，以确保解除的合法性和有效性。
风险提示：
- 如果合同未解除，一方可能因合同持续存在而被追究未履行义务的责任，从而引发不必要的法律纠纷和损失。
- 因此，在合同事实上不能履行的情况下，及时解除合同是保护自身合法权益的重要措施。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份货物买卖合同，约定甲向乙提供特定型号的货物。然而，在履行过程中，该货物因技术问题停产，导致甲事实上无法向乙交付货物。此时，虽然合同在事实上已经无法履行，但甲乙双方仍应通过协商或单方解除的方式解除合同，以明确双方的权利义务关系已经终止，并处理已履行部分和损失。
综上所述，合同因事实上不能履行已经终止时，仍建议进行解除操作。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。