女员工休产假90天是否合法，需结合具体地区和单位政策来判断，但一般来说，若符合当地规定，则是合法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律法规角度
国家层面规定：
- 根据《女职工劳动保护特别规定》，女职工生育享受98天产假，其中产前可以休假15天；难产的，增加产假15天；生育多胞胎的，每多生育1个婴儿，增加产假15天。这是国家层面的基本规定，为女职工提供了基本的产假保障。
地方层面规定：
- 各地根据实际情况，可能制定了更为详细或略有不同的产假政策。例如，有些地区可能规定女职工除享受国家规定的产假外，还享有额外的奖励假或地方性产假。因此，90天产假是否合法，需首先查看当地的具体规定。
二、单位政策角度
单位内部规定：
- 除了法律法规外，单位内部也可能有关于产假的具体规定。这些规定可能基于单位实际情况、员工福利政策或行业惯例等因素制定。如果单位内部规定的产假天数不少于当地法律法规规定的最低天数，那么该规定是合法的。
单位执行情况：
- 即使单位有明确的产假政策，但在实际执行过程中也可能存在偏差。例如，单位可能因工作需要、人员安排等原因，对女职工的产假申请进行限制或调整。这种情况下，女职工有权依据法律法规和单位政策，维护自己的合法权益。
三、实际操作建议
了解当地规定：
- 女职工在申请产假前，应首先了解当地关于产假的具体规定，包括产假天数、申请条件、审批流程等。这有助于女职工明确自己的权益，避免因信息不对称而遭受损失。
与单位沟通：
- 在了解当地规定的基础上，女职工应与单位进行充分沟通，明确自己的产假申请和单位政策之间的符合程度。如果单位政策与当地规定存在冲突或不明确之处，女职工可以要求单位进行解释或调整。
维护自身权益：
- 如果女职工在产假期间遭遇不公正待遇或权益受损，如产假被缩短、工资被扣减等，女职工有权依据法律法规和单位政策，通过合法途径维护自己的权益。这包括向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等。
总结来说，女员工休产假90天是否合法，需结合当地法律法规和单位政策来判断。如果当地规定或单位政策明确规定了产假天数，且该天数不少于国家规定的最低天数，那么女员工休产假90天就是合法的。如果有任何疑问或遭遇不公正待遇，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。