结论：一般情况下，先用作公司出资的房产后做了抵押，不能直接排除抵押权的执行，但存在一些特殊情形可能影响执行结果。以下从不同角度进行分析：
一、正常抵押权执行情况
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，抵押权是债权人对抵押物享有的优先受偿权。当债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形时，债权人有权就该抵押物优先受偿。若房产先用于公司出资，之后又设立了抵押权，且抵押权的设立符合法律规定（如办理了抵押登记等），那么在债务人无法清偿债务时，抵押权人通常有权依法执行该抵押房产。
- 实际影响：从实际操作层面看，一旦抵押权成立并生效，抵押权人就可以按照法定程序，如向法院申请拍卖、变卖抵押房产，并从所得价款中优先受偿。此时，公司出资这一事实并不能直接阻碍抵押权的执行，因为抵押权的效力具有相对独立性，其设立和行使主要依据抵押合同和相关法律规定。
二、可能排除抵押权执行的特殊情形
- 抵押权设立存在瑕疵：
- 未办理抵押登记：如果抵押权未依法办理抵押登记，根据法律规定，可能不得对抗善意第三人。在某些情况下，如果公司出资后，抵押权人未办理抵押登记，而后续有其他善意第三人取得了与该房产相关的权益（如购买了部分产权等），那么抵押权人可能无法直接执行该房产。
- 抵押合同无效：若抵押合同存在违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗等情形，导致抵押合同无效，那么抵押权自然也无法成立，此时就可以排除抵押权的执行。例如，抵押人与抵押权人恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益而订立的抵押合同就是无效的。
- 公司出资与抵押权冲突的特殊处理：
- 出资义务履行与抵押权行使的平衡：在某些极端情况下，如果公司出资后，房产的抵押权行使会严重损害公司其他股东或债权人的利益，且存在合理的解决方案来平衡各方利益（如提供其他等值财产作为担保等），法院可能会根据具体情况，对抵押权的执行进行一定的限制或调整。但这种情况非常罕见，需要满足严格的法律条件和事实依据。
- 涉及公司破产等特殊程序：如果公司进入破产程序，根据《企业破产法》的相关规定，抵押权人的债权虽然属于优先受偿的范围，但在破产程序中，也需要遵循一定的程序和规则。例如，破产管理人可能会对抵押物的价值进行评估，并按照法定顺序清偿债务。在某些情况下，如果抵押物的价值远超过抵押债权，且存在其他需要优先清偿的债务（如职工工资、税款等），法院可能会对抵押权的执行进行一定的干预。
建议：如果您面临此类问题，建议首先收集并整理相关证据，如房产出资证明、抵押合同、抵押登记证明等。然后，根据具体情况，咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。