针对“发函询问串标怎么回复”这一问题，核心要点在于如何合法、合规且有效地回应关于串通投标的质疑或询问。以下从不同角度给出分析和建议：

1. 确认发函主体与性质

• 若发函方为行政机关（如招投标监管部门）：
  需高度重视，及时整理相关投标文件、沟通记录、报价依据等材料，书面回复并附证据，重点说明报价合理性、决策独立性，避免被认定为串标。
  示例回复逻辑：
  “我司参与XX项目投标过程中，严格遵循《招标投标法》及相关规定，报价基于成本测算与市场调研，与其他投标人无任何关联或协商行为。附：投标文件、成本分析表、独立决策记录等。”

• 若发函方为其他投标人或利害关系人：
  需谨慎处理，避免直接承认或否认串标（可能引发法律风险）。可要求对方提供具体证据，并声明保留追究诽谤的权利。
  示例回复逻辑：
  “我司注意到贵方关于串标的质疑，但未收到任何实质性证据。我司投标行为合法合规，若贵方继续散布不实信息，我司将依法维权。”

2. 回复内容的核心要点

• 否认串标行为：明确声明未与其他投标人协商报价、未分割市场、未操纵投标结果。
  
• 提供证据支持：如独立报价依据、决策流程文件、与招标人的沟通记录等。
  
• 强调合规性：引用《招标投标法》第三十二条（禁止串通投标）等条款，表明自身行为符合法律规定。
  
• 保留法律权利：若对方行为构成侵权，可声明将追究法律责任。

3. 风险提示与建议

• 避免自证陷阱：无需过度解释或主动提供可能被误解的信息（如与其他投标人的过往合作记录）。
  
• 及时咨询律师：若发函内容涉及行政调查或诉讼风险，建议委托律师协助回复，确保程序合法。
  
• 内部自查：回复前需核实公司内部是否存在违规行为，防止因内部问题导致回复失效。

4. 回复形式建议

• 书面函件：优先采用正式书面形式，加盖公章，确保法律效力。
  
• 证据附件：将关键证据（如报价表、决策记录）作为附件，便于对方核查。
  
• 送达方式：通过EMS或公证送达，保留送达凭证。

总结：回复串标询问需结合发函主体、证据充分性、法律风险综合判断，核心是否认违规、提供证据、强调合规、保留权利。如有具体案例或函件内容，可进一步提供细节，我将协助完善回复方案。