车辆合作协议并不必然构成劳动关系，其是否构成劳动关系需依据协议的具体内容及双方的实际履行情况来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、劳动关系的认定标准
根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号）第一条，劳动关系成立需同时具备以下情形：
- 主体资格：用人单位和劳动者需符合法律、法规规定的主体资格。
- 从属性：
- 人身从属性：劳动者需遵守用人单位的规章制度，接受管理、指挥与监督，如明确的工作时间、地点、任务安排等。
- 经济从属性：劳动者所获报酬为其主要生活来源，且支付方式、时间与劳动关系中的工资支付相似，如按月固定金额支付，并承担社会保险费用。
- 业务组成部分：劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。
二、车辆合作协议可能构成的关系类型
劳动关系：
- 若车辆合作协议中明确规定了劳动者需遵守用人单位的规章制度，接受管理、指挥与监督，且劳动者所获报酬为其主要生活来源，支付方式、时间与劳动关系中的工资支付相似，则该协议可能构成劳动关系。
- 实际案例：如某物流公司与货车司机签订《全日制劳动合同书》后，又签订《承包经营管理合同》，但若公司未对司机进行管理、监督，司机的工资、社会保险等费用均不是公司发放，则该劳动合同并未实际履行，双方不构成劳动关系。
劳务关系：
- 若车辆合作协议中双方地位平等，提供劳务的一方具有较高的自主性，可自行安排工作时间、方式等，只需按约定完成工作成果，且报酬一般根据工作量或工作成果来计算，则该协议可能构成劳务关系。
- 特点：劳务关系相对灵活，双方可根据需要随时调整合作内容或终止合作。
纯粹的合作关系：
- 若车辆合作协议构建的是一种平等主体间纯粹的合作关系，双方共同出资、共同经营、共担风险、共享收益，且不存在一方对另一方的管理与被管理关系，则该协议可能构成纯粹的合作关系。
- 示例：两个企业共同投资开发物流项目，按约定比例出资、承担责任并分配利润。
三、法律建议
- 明确协议内容：在签订车辆合作协议时，应明确双方的身份、合作内容、报酬支付方式、管理方式等关键条款，以便在发生争议时能够准确判断合作关系的性质。
- 保留证据：双方应保留与协议履行相关的证据，如工作记录、报酬支付凭证等，以备不时之需。
- 咨询专业律师：若对协议性质或双方权利义务存在疑问，建议及时咨询专业律师，以确保协议的合法性和有效性，并避免潜在的法律风险。
在实际操作中，判断车辆合作协议的性质对于确定双方的权利义务、解决纠纷具有重要意义。因此，在签订和履行协议时，双方应谨慎对待，确保协议的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。