您好，关于您提出的“在国内养小矮马作为宠物是否合法以及需要办理哪些手续”的问题，我将为您详细解答。

首先，需要明确的是，小矮马若属于国家重点保护的陆生野生动物范畴，那么饲养它作为宠物就需要遵循相关的法律法规。根据《国家重点保护野生动物驯养繁殖许可证管理办法》，从事驯养繁殖野生动物的单位和个人，必须取得《国家重点保护野生动物驯养繁殖许可证》（以下简称《驯养繁殖许可证》）。没有取得此证的单位和个人，不得从事野生动物驯养繁殖活动。

关于是否合法：

• 如果小矮马不属于国家重点保护的野生动物，那么饲养它作为宠物在法律上可能是允许的，但具体还需根据地方性法规和政策来确定。
• 如果小矮马属于国家重点保护的野生动物，那么未经许可饲养它作为宠物就是违法的。

关于需要办理的手续：

1. 确认小矮马是否属于保护动物：

   • 您需要首先确认小矮马是否被列入国家重点保护野生动物名录。这可以通过查询相关法律法规或咨询当地林业部门来确认。

2. 申请《驯养繁殖许可证》（如果小矮马属于保护动物）：

   • 具备适宜驯养繁殖野生动物的固定场所和必需的设施。
   • 具备与驯养繁殖野生动物种类、数量相适应的人员和技术。
   • 驯养繁殖野生动物的饲料来源有保证。
   • 向所在地县级政府野生动物行政主管部门提出书面申请，并填写《国家重点保护野生动物驯养繁殖许可证申请表》。
   • 驯养繁殖国家一级保护野生动物的，需由省、自治区、直辖市政府林业行政主管部门报林业部审批；驯养繁殖国家二级保护野生动物的，由省、自治区、直辖市政府林业行政主管部门审批。

3. 遵守相关规定：

   • 获得《驯养繁殖许可证》后，必须按照许可证规定的种类进行驯养繁殖活动。
   • 接受野生动物的行政主管部门的监督检查和指导。
   • 建立野生动物驯养繁殖档案和统计制度。
   • 按有关规定出售、利用其驯养繁殖野生动物及其产品（如需）。

4. 注意变更和终止手续：

   • 如果需要变更驯养繁殖野生动物种类，应在规定时间内向原批准机关申请办理变更手续。
   • 如果需要终止驯养繁殖野生动物活动，也应在规定时间内向原批准机关办理终止手续，并交回原《驯养繁殖许可证》。

建议：

• 在决定饲养小矮马作为宠物之前，请务必确认其法律地位，并咨询当地林业部门或相关机构以获取准确的信息和指导。
• 如果小矮马属于国家重点保护的野生动物，且您希望饲养它作为宠物，那么请务必按照法律法规的要求申请《驯养繁殖许可证》，并严格遵守相关规定。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。