一审判决免于刑事处罚，二审发回，再审改判无罪的，赔偿义务机关是作出一审有罪判决的人民法院。以下从法律条款和具体分析两个角度进行阐述：
法律条款
根据《中华人民共和国国家赔偿法》第二十一条第四款的规定：“二审改判无罪，以及二审发回重审后作无罪处理的，作出一审有罪判决的人民法院为赔偿义务机关”。这一条款明确规定了在一审有罪判决后，经过二审或再审程序最终改判无罪的情况下，赔偿义务机关的确定原则。
具体分析
一审有罪判决的性质：
- 一审法院作出的有罪免处判决，虽然量刑上免除了刑事处罚，但判决性质上仍属于有罪判决。
- 有罪判决意味着法院认定了被告人的犯罪行为，这一认定是后续赔偿义务确定的基础。
赔偿义务机关的确定：
- 根据国家赔偿法的规定，赔偿义务机关的确定与判决的有罪或无罪性质直接相关。
- 在一审有罪判决后，无论二审是直接改判无罪还是发回重审后作无罪处理，赔偿义务机关均为一审法院。
- 这是因为一审法院是作出有罪判决的机关，其判决行为直接导致了被告人的权益受损，因此应当承担赔偿责任。
羁押与赔偿范围的关系：
- 被告人是否被羁押是解决赔偿范围的问题，与如何确定赔偿义务机关是两个不同的概念。
- 国家赔偿法并未规定用赔偿范围来推导适用确定赔偿义务机关，二者不能混淆。
- 因此，无论一审法院判决是否造成被告人的羁押，有罪判决是一审法院作出的，一审法院就应当是赔偿义务机关。
总结与建议：
- 在您所描述的情况下，赔偿义务机关是作出一审有罪判决的人民法院。
- 如果您或您的亲友遇到了类似的情况，建议及时向作出一审有罪判决的人民法院提出国家赔偿申请。
- 在申请过程中，如果遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。