刑事案件中，申请国家赔偿的时效一般为两年。以下是关于这一期限的详细解释和特殊情况说明：
一、一般申请期限
赔偿请求人的申请期限：
- 根据《国家赔偿法》第三十九条，赔偿请求人请求国家赔偿的时效为两年，自其知道或者应当知道国家机关及其工作人员行使职权时的行为侵犯其人身权、财产权之日起计算。但需要注意的是，被羁押等限制人身自由期间不计算在内。
- 若赔偿请求人在赔偿请求时效的最后六个月内，因不可抗力或者其他障碍不能行使请求权的，时效中止。从中止时效的原因消除之日起，赔偿请求时效期间继续计算。
- 如果赔偿请求人在申请行政复议或者提起行政诉讼时一并提出赔偿请求的，将适用行政复议法、行政诉讼法有关时效的规定。
赔偿义务机关的决定期限：
- 赔偿义务机关在收到赔偿申请后，应在两个月内作出是否赔偿的决定。这一过程中，赔偿义务机关应充分听取赔偿请求人的意见，并可以就赔偿方式、赔偿项目和赔偿数额进行协商。
二、特殊情况的申请期限
复议申请期限：
- 如果赔偿义务机关在规定期限内未作出赔偿决定，或者赔偿请求人对赔偿方式、项目和数额有异议，或者赔偿义务机关作出不予赔偿的决定的，赔偿请求人可以在上述期限届满或者赔偿义务机关作出不予赔偿决定之日起三十日内，向赔偿义务机关的上一级机关申请复议。
- 复议机关应在收到复议申请之日起两个月内作出决定。
向人民法院赔偿委员会申请的期限：
- 如果赔偿请求人对复议决定不服，或者在复议机关逾期未作出决定的情况下，赔偿请求人可以在收到复议决定之日起三十日内，或者在复议机关逾期未作出决定之日起三十日内，向复议机关所在地的同级人民法院赔偿委员会申请作出赔偿决定。
- 人民法院赔偿委员会应在收到赔偿申请之日起三个月内作出决定；属于疑难、复杂、重大案件的，经本院院长批准，可以延长三个月。
三、综合建议
- 及时申请：由于刑事案件国家赔偿的申请期限较为严格，且涉及复杂的法律程序和证据收集，因此建议赔偿请求人在知道或应当知道其权益被侵犯后，尽快向赔偿义务机关提出赔偿申请，以免错过申请时机。
- 专业指导：鉴于刑事案件国家赔偿申请的复杂性和专业性，建议赔偿请求人在申请前咨询专业律师或法律机构，以确保其申请得到及时、有效的处理。
在处理刑事案件国家赔偿申请时，务必遵循相关法律法规和程序要求，以确保自身权益得到充分保障。如果你有任何关于刑事案件国家赔偿申请的具体问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。