针对教师拿教辅回扣5000元这一问题，这是一个涉及师德师风和职业操守的严重违规行为，必须得到严肃处理。以下是我为您提供的详细解答：
一、违规行为的性质与后果
教师拿教辅回扣，属于利用职务之便谋取私利，违反了教师职业道德和职业操守，也损害了教育公平和学生的利益。这种行为一旦查实，将面临严重的纪律处分，包括但不限于警告、记过、降级、撤职甚至开除公职等。同时，还可能涉及法律责任，如受贿罪等，将受到法律的制裁。
二、处理流程与建议
立即停止违规行为： 一旦发现教师有拿教辅回扣的行为，应立即停止该行为，并主动向学校或教育主管部门报告，争取从轻处理。
配合调查： 学校或教育主管部门在接到举报或发现违规行为后，会展开调查。教师应积极配合调查，如实陈述事实，提供相关证据。
接受纪律处分： 根据调查结果，学校或教育主管部门会依据相关规定对违规教师进行纪律处分。教师应接受处分，并认真反思自己的行为，积极改正错误。
退还违法所得： 如果教师已经收取了教辅回扣，应主动退还违法所得，以减轻处分和法律责任。
加强师德师风建设： 学校和教育主管部门应加强对教师的师德师风教育，提高教师的职业操守和道德水平，防止类似违规行为再次发生。
三、相关政策与法规
教育部办公厅曾发布《关于开展中小学有偿补课和教师违规收受礼品礼金问题专项整治工作的通知》，明确指出要严肃查处教师违规收受礼品礼金等行为。此外，各地也出台了相应的规定和措施，加强对教师职业行为的监管和处罚。
四、案例警示
以某县恩江中学原校长王某为例，他因利用职务便利帮助推销教辅资料并大肆收受回扣，被给予开除党籍、开除公职处分。这一案例警示我们，教师必须严格遵守职业道德和职业操守，不得利用职务之便谋取私利。
五、总结与建议
教师拿教辅回扣是严重的违规行为，必须得到严肃处理。学校和教育主管部门应加强对教师的监管和教育，提高教师的职业操守和道德水平。同时，教师也应自觉遵守相关规定和法规，不得利用职务之便谋取私利。如果发现违规行为，应及时向学校或教育主管部门报告，并积极配合调查和处理工作。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。